RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 PFDN1O60925 122 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 TSC22D2O75157 780 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 LY6G6CO95867 125 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 SCGB1D2O95969 90 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC25A4P12235 298 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 GPR183P32249 361 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 NPBWR1P48145 328 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 PAX9P55771 341 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 RAB11AP62491 216 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 OR4X1Q8NH49 305 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 CACNG8Q8WXS5 425 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 PSENENQ9NZ42 101 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 A8MZ25 164 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 PRSS46E5RG02 174 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 GNG7O60262 68 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 CLN5O75503 358 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 SCGB2A1O75556 95 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 SIX6O95475 246 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM50AO95807 157 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 IFNA4P05014 189 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 CTSGP08311 255 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 ADMP35318 185 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 BCAP31P51572 246 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 H2BFSP57053 126 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 SYNJ2BPP57105 145 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 RAB32Q13637 225 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 MLANAQ16655 118 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 Q56UQ5 140 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 PEMTQ9UBM1 199 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 H3BP45 60 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 L7N2F9 121 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 NDUFA4O00483 81 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 DEDDO75618 318 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 OR2C1O95371 312 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 IGHV3-48P01763 117 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 VAMP2P63027 116 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 MED28Q9H204 178 aa6.57□□□□□ -1.36
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CLSTN3-212ENST00000541770 A8MWP6 167 aa6.56□□□□□ -1.36
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CLSTN3-212ENST00000541770 IGLV1-51P01701 117 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 RLN2P04090 185 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 RND2P52198 227 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 S100A10P60903 97 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
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CLSTN3-212ENST00000541770 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 AKAP14Q86UN6 197 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 ASB13Q8WXK3 278 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 NPIPB3Q92617 1050 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 PPP1R14BQ96C90 147 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC35E1Q96K37 410 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 E5RGE8 158 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 K7EMT4 169 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 IGKV1-17P01599 117 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 CSN3P07498 182 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 IGLC1P0CG04 106 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 PET100P0DJ07 73 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 CXCL3P19876 107 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 OR10J1P30954 320 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 DLK1P80370 383 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 FCN2Q15485 313 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 GGACTQ9BVM4 153 aa6.55□□□□□ -1.36
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