RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513423.1

FGFR4-215, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, human

TSL 2

Gene FGFR4, Length 445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGFR4-215	ENST00000513423	GP9	P14770	177 aa		10.28	□□□□□ -0.76
FGFR4-215	ENST00000513423	GAMT	Q14353	236 aa		10.28	□□□□□ -0.76
FGFR4-215	ENST00000513423	TIGIT	Q495A1	244 aa		10.28	□□□□□ -0.76
FGFR4-215	ENST00000513423	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
FGFR4-215	ENST00000513423	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		10.28	□□□□□ -0.76
FGFR4-215	ENST00000513423	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		10.28	□□□□□ -0.76
FGFR4-215	ENST00000513423	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		10.28	□□□□□ -0.76
FGFR4-215	ENST00000513423	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		10.28	□□□□□ -0.76
FGFR4-215	ENST00000513423	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		10.28	□□□□□ -0.76
FGFR4-215	ENST00000513423	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		10.28	□□□□□ -0.76
FGFR4-215	ENST00000513423	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
FGFR4-215	ENST00000513423	MLX	Q9UH92	298 aa		10.28	□□□□□ -0.76
FGFR4-215	ENST00000513423	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
FGFR4-215	ENST00000513423	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		10.27	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	SIX6	O95475	246 aa		10.27	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	OR10J1	P30954	320 aa		10.27	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		10.27	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	MRAP	Q8TCY5	172 aa		10.27	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		10.27	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	ACY3	Q96HD9	319 aa		10.27	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	SMPX	Q9UHP9	88 aa		10.27	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	10.27	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		10.26	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	ZNF785	A8K8V0	405 aa		10.26	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	GOSR2	O14653	212 aa		10.26	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	TSC22D2	O75157	780 aa		10.26	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	RAB32	Q13637	225 aa		10.26	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	LCN12	Q6JVE5	192 aa		10.26	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		10.26	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	CHEK1	O14757	476 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	SCGB2A1	O75556	95 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	CCNK	O75909	580 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	BTNL8	Q6UX41	500 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423		Q8N1Y9	231 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	SLC35E1	Q96K37	410 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	NMES1	Q9C002	83 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	ALG5	Q9Y673	324 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	SSNA1	O43805	119 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	H2BFS	P57053	126 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	THAP8	Q8NA92	274 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423		Q8WTZ3	238 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	GINS3	Q9BRX5	216 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423		L7N2F9	121 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	TOMM40	O96008	361 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	RD3L	P0DJH9	198 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	PSG1	P11464	419 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	VAMP2	P63027	116 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	ARL16	Q0P5N6	197 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	OXA1L	Q15070	435 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	RGS21	Q2M5E4	152 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	TRGV9	Q99603	122 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	SORL1	Q92673	2214 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	ZFP92	A6NM28	416 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	FNDC10	F2Z333	226 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	NPPC	P23582	126 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	CRYBB3	P26998	211 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	S100A10	P60903	97 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	DLK1	P80370	383 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	ZNF90	Q03938	601 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	LILRB2	Q8N423	598 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	RNF2	Q99496	336 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	VSIR	Q9H7M9	311 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423		U3KQE9	123 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423		H0YIZ8	118 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	DEDD	O75618	318 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	GUCA2B	Q16661	112 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	ST8SIA2	Q92186	375 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	METTL26	Q96S19	204 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FGFR4-215	ENST00000513423	IGSF23	A1L1A6	192 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FGFR4-215	ENST00000513423	TSPAN4	O14817	238 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FGFR4-215	ENST00000513423	IL4	P05112	153 aa		10.2	□□□□□ -0.78

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