RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 DHRS2Q13268 280 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 GGNBP1Q5YKI7 109 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 GBGT1Q8N5D6 347 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 ACY3Q96HD9 319 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 MAGT1Q9H0U3 335 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 VSIRQ9H7M9 311 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 EDA2RQ9HAV5 297 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4E1P0C645 316 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 OR10J1P30954 320 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 TCF24Q7RTU0 167 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 NPIPB3Q92617 1050 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 TMED3Q9Y3Q3 217 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 AGRNO00468 2067 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 RYR3Q15413 4870 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4C46A6NHA9 309 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 DFFBO76075 338 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A4P12235 298 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 CNPY1Q3B7I2 92 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 LYG2Q86SG7 212 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 APRG1Q8IVJ8 170 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM24BQ8N5W8 94 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 OR1S2Q8NGQ3 325 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 GGTLC1Q9BX51 225 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 C20orf85Q9H1P6 137 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 U3KQ87 197 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 LYRM1O43325 122 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A6P12236 298 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 MUC7Q8TAX7 377 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 CACFD1Q9UGQ2 172 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 CENPXA8MT69 81 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 H3BP45 60 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 METTL26Q96S19 204 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 MAP6D1Q9H9H5 199 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 A6NHS1 94 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM90A26D6RGX4 464 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 IFNA4P05014 189 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 CRYBB3P26998 211 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 P2RY1P47900 373 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 C4orf46Q504U0 113 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 ETFRF1Q6IPR1 90 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 WFDC3Q8IUB2 231 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 MS4A6AQ9H2W1 248 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAV6A0A075B6T7 132 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 PRSS46E5RG02 174 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 WRBO00258 174 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 SYNGR2O43760 224 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 SCGB2A1O75556 95 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 IL4P05112 153 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 NPPCP23582 126 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 GAMTQ14353 236 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 NOXA1Q86UR1 476 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D24Q9ULP9 559 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP2-218ENST00000511185 TOMM40O96008 361 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF90Q03938 601 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4D5Q8NGN0 318 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 COQ8AQ8NI60 647 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC32Q9BV29 185 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 U3KQE9 123 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 CCSO14618 274 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 PSG1P11464 419 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 BMI1P35226 326 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 RPL11P62913 178 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 DEFB135Q30KP9 77 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 CASC10Q5T4H9 136 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFAND6Q6FIF0 208 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC35E1Q96K37 410 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 NUDT15Q9NV35 164 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 LYSTQ99698 3801 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 C3orf84H3BNL1 204 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 SSSCA1O60232 199 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 MED6O75586 246 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 TCRBP04435 133 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 SPANXN5Q5MJ07 72 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 LEMD1Q68G75 181 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 STXBP6Q8NFX7 210 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 OR51G1Q8NGK1 321 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 Q8WTZ3 238 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 GLMPQ8WWB7 406 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 SEC22CQ9BRL7 303 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 OVOL2Q9BRP0 275 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 RABAC1Q9UI14 185 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFP92A6NM28 416 aa13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 CCNKO75909 580 aa13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
SH3BP2-218ENST00000511185 MITD1Q8WV92 249 aa13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms