RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 FABP1P07148 127 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 IGLC1P0CG04 106 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 PAX9P55771 341 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 NPIPB3Q92617 1050 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 ACY3Q96HD9 319 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 ALG5Q9Y673 324 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 C8orf88P0DMB2 117 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 BMI1P35226 326 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 S100A10P60903 97 aa20.38■□□□□ 0.85
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SH3BP2-212ENST00000508338 OXA1LQ15070 435 aa20.38■□□□□ 0.85
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SH3BP2-212ENST00000508338 C20orf24Q9BUV8 137 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 SORL1Q92673 2214 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 OR10P1Q8NGE3 313 aa20.37■□□□□ 0.85
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SH3BP2-212ENST00000508338 MGAT4CQ9UBM8 478 aa20.37■□□□□ 0.85
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SH3BP2-212ENST00000508338 FNDC10F2Z333 226 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 IGKV1-17P01599 117 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 KRTAP10-11P60412 298 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 RAB32Q13637 225 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 TM4SF20Q53R12 229 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
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SH3BP2-212ENST00000508338 TOMM20LQ6UXN7 152 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 GGACTQ9BVM4 153 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 ZFP92A6NM28 416 aa20.34■□□□□ 0.85
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SH3BP2-212ENST00000508338 BCAP31P51572 246 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 DLK1P80370 383 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 TIGITQ495A1 244 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 MED28Q9H204 178 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 DEDDO75618 318 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 METTL15P1P0C7V9 234 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 CAV2P51636 162 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 H2BFSP57053 126 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 DEFB114Q30KQ6 69 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 OR8G2PQ6IF36 304 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-212ENST00000508338 PMS2P5A8MQ11 134 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 TOMM40O96008 361 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 CD5P06127 495 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 RD3LP0DJH9 198 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 THAP8Q8NA92 274 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 ASB13Q8WXK3 278 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 TRGV9Q99603 122 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 C11orf1Q9H5F2 150 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 ZFAND3Q9H8U3 227 aa20.32■□□□□ 0.84
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SH3BP2-212ENST00000508338 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa20.31■□□□□ 0.84
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SH3BP2-212ENST00000508338 CFDP00746 253 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 AKR1C1Q04828 323 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 STX12Q86Y82 276 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF414Q96IQ9 312 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 METTL26Q96S19 204 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM231Q9H6L2 316 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 SMPXQ9UHP9 88 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 GP9P14770 177 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM144Q7Z5S9 345 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A1W2PS18 150 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 NPPCP23582 126 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 HBG1P69891 147 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 HBG2P69892 147 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 OR51G1Q8NGK1 321 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC25A31Q9H0C2 315 aa20.29■□□□□ 0.84
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SH3BP2-212ENST00000508338 MLXQ9UH92 298 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 PFDN2Q9UHV9 154 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 P2RY1P47900 373 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 SULT1A1P50225 295 aa20.28■□□□□ 0.84
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SH3BP2-212ENST00000508338 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
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SH3BP2-212ENST00000508338 DNAH3Q8TD57 4116 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 SMCO3A2RU48 225 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 S100A11P31949 105 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM252Q8N6L7 170 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-212ENST00000508338 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 IL4P05112 153 aa20.26■□□□□ 0.83
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SH3BP2-212ENST00000508338 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa20.26■□□□□ 0.83
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