RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497700.1

ELL3-208, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, human

TSL 3

Gene ELL3, Length 574 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ELL3-208	ENST00000497700	BSX	Q3C1V8	233 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	LYST	Q99698	3801 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	ZMAT4	Q9H898	229 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	TEX22	C9J3V5	150 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	NPY1R	P25929	384 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	HBG1	P69891	147 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	HBG2	P69892	147 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	WT1-AS	Q06250	92 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	CITED4	Q96RK1	184 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	OR13C7	P0DN81	318 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	SNCA	P37840	140 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	RAB11A	P62491	216 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	C2orf83	Q53S99	150 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	STOML3	Q8TAV4	291 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ELL3-208	ENST00000497700	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	DFFB	O76075	338 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	JTB	O76095	146 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	TPPP2	P59282	170 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	CLINT1	Q14677	625 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700		Q8N1Y9	231 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	LFNG	Q8NES3	379 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	ST8SIA2	Q92186	375 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	AREG	P15514	252 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	13.69	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	DEFA5	Q01523	94 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	ATP6V1F	Q16864	119 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	ZNF114	Q8NC26	417 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	ATP5S	Q99766	215 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	ARV1	Q9H2C2	271 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	PRSS46	E5RG02	174 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	IFNA4	P05014	189 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	ZNF266	Q14584	549 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	BAP18	Q8IXM2	172 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	MED9	Q9NWA0	146 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	REG1A	P05451	166 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	LILRB2	Q8N423	598 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	GGACT	Q9BVM4	153 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	IGLV1-51	P01701	117 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	TRGV3	P03979	118 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	APELA	P0DMC3	54 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	DLK1	P80370	383 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	VWC2	Q2TAL6	325 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	GINS3	Q9BRX5	216 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	IFNA5	P01569	189 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	CRYGC	P07315	174 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	CTRB1	P17538	263 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	OR1P1	Q8NH06	330 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ELL3-208	ENST00000497700	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	FNDC10	F2Z333	226 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	MFAP2	P55001	183 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	OR5T1	Q8NG75	326 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		13.63	□□□□□ -0.23

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