RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495702.5

CEP41-215, Transcript of centrosomal protein 41, human

TSL 1 (best)

Gene CEP41, Length 733 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP41-215	ENST00000495702	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	EHF	Q9NZC4	300 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	AGRN	O00468	2067 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	PMP2	P02689	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	HTN3	P15516	51 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	SNCA	P37840	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	CBX5	P45973	191 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	P2RY1	P47900	373 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	DHRS2	Q13268	280 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	RNF212	Q495C1	297 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	PSMG4	Q5JS54	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	IDNK	Q5T6J7	187 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	METTL26	Q96S19	204 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	HELT	A6NFD8	242 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	GPR31	O00270	319 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	CD74	P04233	296 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	CRYBB3	P26998	211 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	SDC2	P34741	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	AQP4	P55087	323 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	MXD1	Q05195	221 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	SPINK9	Q5DT21	86 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	FAM210B	Q96KR6	192 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	IFT46	Q9NQC8	304 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	SSR3	Q9UNL2	185 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702		A0A0A6YYH2	397 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702		A6NJ64	397 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702		H3BMM0	161 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	CLN5	O75503	358 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	S100G	P29377	79 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	ETV6	P41212	452 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	FXYD7	P58549	80 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	TSPAN5	P62079	268 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	RAB26	Q9ULW5	256 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	CORT	O00230	105 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	PSMB9	P28065	219 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	OPRK1	P41145	380 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	GABARAPL2	P60520	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	SLC35G3	Q8N808	338 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	OR4X1	Q8NH49	305 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702		Q8WTZ3	238 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	FCGR1B	Q92637	280 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	CNBD2	Q96M20	576 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	ENY2	Q9NPA8	101 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CEP41-215	ENST00000495702	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms