RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 PALMDQ9NP74 551 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 MLXQ9UH92 298 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 PRSS46E5RG02 174 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 PRAF2O60831 178 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 YIF1AO95070 293 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 IGKV1-17P01599 117 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 IGLC1P0CG04 106 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 PAX9P55771 341 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 RAB11AP62491 216 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 BTNL8Q6UX41 500 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 ACY3Q96HD9 319 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 C2orf50Q96LR7 162 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 PSENENQ9NZ42 101 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 ZNF785A8K8V0 405 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 K7EMT4 169 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 K7EPK0 472 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 GOSR2O14653 212 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 CCNKO75909 580 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 SIX6O95475 246 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 PTTG1O95997 202 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 OR10J1P30954 320 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 IL15RAQ13261 267 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 GAMTQ14353 236 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 LCN12Q6JVE5 192 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 MARC2Q969Z3 335 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 SMIM8Q96KF7 97 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 C7orf66A4D0T2 115 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 RAB32Q13637 225 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 Q8N1Y9 231 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 SLC35E1Q96K37 410 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 RAB40CQ96S21 281 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 SMPXQ9UHP9 88 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 CHEK1O14757 476 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 TSC22D2O75157 780 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 SCGB2A1O75556 95 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 TOMM40O96008 361 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 CD7P09564 240 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 TAS2R30P59541 319 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 S100A10P60903 97 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 ZNF90Q03938 601 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 ARL16Q0P5N6 197 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 GUCA2BQ16661 112 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 LILRB2Q8N423 598 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 Q8WTZ3 238 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 ST8SIA2Q92186 375 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 RNF2Q99496 336 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 GINS3Q9BRX5 216 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 ALG5Q9Y673 324 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-216ENST00000495123 ZFP92A6NM28 416 aa6.49□□□□□ -1.37
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