RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 HELTA6NFD8 242 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF728P0DKX0 622 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 MBD6Q96DN6 1003 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 TPPP3Q9BW30 176 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 WNT10AQ9GZT5 417 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 OVOL3O00110 214 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 SNAI2O43623 268 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 CA2P00918 260 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHG4P01861 327 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 WNT2P09544 360 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 IGLL1P15814 213 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 GATA3P23771 443 aa5.91□□□□□ -1.46
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SMARCE1-211ENST00000493660 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 HLA-DRB5Q30154 266 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM30BQ3MIR4 351 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa5.91□□□□□ -1.46
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SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2C3Q8N628 320 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 SGMS2Q8NHU3 365 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 TIMD4Q96H15 378 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 GRAMD2BQ96HH9 432 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 COMMD5Q9GZQ3 224 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 EPG5Q9HCE0 2579 aa5.91□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 TUSC2O75896 110 aa5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 TGFAP01135 160 aa5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 SCTP09683 121 aa5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 COL8A2P25067 703 aa5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 REG1BP48304 166 aa5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 EFNA4P52798 201 aa5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM155Q4W5P6 130 aa5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 VSTM2AQ8TAG5 236 aa5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ABHD14BQ96IU4 210 aa5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 CCL13Q99616 98 aa5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.9□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa5.9□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFB3O43676 98 aa5.9□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 HERV-K104P61576 105 aa5.9□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 RELBQ01201 579 aa5.9□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 GCSAMLQ5JQS6 135 aa5.9□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa5.9□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 LCNL1Q6ZST4 164 aa5.9□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 LRTM2Q8N967 370 aa5.9□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNRF1Q8ND25 227 aa5.9□□□□□ -1.47
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SMARCE1-211ENST00000493660 C11orf1Q9H5F2 150 aa5.9□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.9□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa5.89□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1W2PS18 150 aa5.89□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 C12orf77C9JDV5 145 aa5.89□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 TMPRSS2O15393 492 aa5.89□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 SPINT2O43291 252 aa5.89□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 ADAM20O43506 726 aa5.89□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 PPYP01298 95 aa5.89□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 TFF1P04155 84 aa5.89□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 PI3P19957 117 aa5.89□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 EDDM3AQ14507 147 aa5.89□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 TTC9CQ8N5M4 171 aa5.89□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM216BQ8N7L0 139 aa5.89□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10AG1Q8NH19 301 aa5.89□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 PTH2Q96A98 100 aa5.89□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00574Q9H8X3 128 aa5.89□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 hADV38S2A0JD32 116 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 C15orf65H3BRN8 121 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 CGB3P0DN86 165 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 CGB7P0DN87 165 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 OR13A1Q8NGR1 328 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 C18orf32Q8TCD1 76 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 PERPQ96FX8 193 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 JMJD8Q96S16 334 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 CCL19Q99731 98 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 C19orf24Q9BVV8 132 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 LIME1Q9H400 295 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 C1RLQ9NZP8 487 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 VPREB3Q9UKI3 123 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00312Q9Y6C7 94 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF462Q96JM2 2506 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 PKDREJQ9NTG1 2253 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM208BQ5VWN6 2430 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 MT-ND6P03923 174 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 PMCHP20382 165 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 CRYBB3P26998 211 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 PSMB3P49720 205 aa5.88□□□□□ -1.47
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