RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487704.5

RTCB-205, Transcript of RNA 2',3'-cyclic phosphate and 5'-OH ligase, human

TSL 2

Gene RTCB, Length 767 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RTCB-205	ENST00000487704	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	DOK5	Q9P104	306 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	KLK11	Q9UBX7	282 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	ERICH4	A6NGS2	130 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	PANO1	I0J062	215 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704		M0R2Z0	102 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	SOCS3	O14543	225 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	CLN5	O75503	358 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	SNAPC5	O75971	98 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	GAGE7	O76087	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	LALBA	P00709	142 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	UCP1	P25874	307 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	CDKN1B	P46527	198 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	WFDC2	Q14508	124 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	LINC01587	Q99440	93 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	COMMD9	Q9P000	198 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704		A0A0J9YXV3	536 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	SULT1C2	O00338	296 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	ISLR	O14498	428 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	RLN2	P04090	185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	FCER2	P06734	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	OR4X1	Q8NH49	305 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	NSG2	Q9Y328	171 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTCB-205	ENST00000487704	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	TNFSF12	O43508	249 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	HTN1	P15515	57 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	GABRB1	P18505	474 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	ETV1	P50549	477 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	ERVK-16	P61578	105 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	CATR1	Q13166	79 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	LCE2C	Q5TA81	110 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	BAP18	Q8IXM2	172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704		Q8WTZ3	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	PHYHIP	Q92561	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	RAB3C	Q96E17	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	AMBN	Q9NP70	447 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	CORT	O00230	105 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	PAX4	O43316	350 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	CD1A	P06126	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	RAB11B	Q15907	218 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	GPR146	Q96CH1	333 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704		A0A0D9SG52	128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	KRAS	P01116	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	DTYMK	P23919	212 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	TALDO1	P37837	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	DHODH	Q02127	395 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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