RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR2T8A6NH00 312 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCL25O15444 150 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 LYZL6O75951 148 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 HTR1AP08908 422 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 BAALC-AS2P0C853 105 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 HLA-DMBP28068 263 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDK9P50750 372 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 RAB8AP61006 207 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 UBE2KP61086 200 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPL30P62888 115 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 STX5Q13190 355 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR4D1Q15615 310 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 C6orf52Q5T4I8 152 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC00471Q8N535 108 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR10D3Q8NH80 312 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR5AK3PQ8NH89 298 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 C4orf3Q8WVX3 66 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 LRRC45Q96CN5 670 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 IMUPQ9GZP8 106 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 RAB1BQ9H0U4 201 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 LRTM1Q9HBL6 345 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TAS2R4Q9NYW5 299 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TP73-AS1Q9UF72 201 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 AK3Q9UIJ7 227 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 USP32Q8NFA0 1604 aa-0.75□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 YEATS4O95619 227 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 FADS2O95864 444 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 LY6G6CO95867 125 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 OTCP00480 354 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 ASS1P00966 412 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPINK1P00995 79 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 COX6A1P12074 109 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 CSN1S1P47710 185 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 FXYD6P3P58550 94 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 HPCAP84074 193 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 KCNJ8Q15842 424 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q5BKY6 102 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 C6orf183Q5T699 404 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM156Q8N614 296 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 PFN4Q8NHR9 129 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 AGR3Q8TD06 166 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SFT2D1Q8WV19 159 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 BBS2Q9BXC9 721 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 CKLFQ9UBR5 152 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM94Q12767 1356 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 RIC1Q4ADV7 1423 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 C10orf71Q711Q0 1435 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TEX14Q8IWB6 1497 aa-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCN3AQ9NY46 2000 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SHROOM2Q13796 1616 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 DLC1Q96QB1 1528 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 DCCP43146 1447 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 C10orf142B7Z368 130 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 K7ERQ8 282 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 LST1O00453 97 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 KDELR1P24390 212 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 PSMD7P51665 324 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR4D2P58180 307 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 PDCL2Q8N4E4 241 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPR32P1Q8NGA4 272 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM106AQ96A25 262 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TSPAN32Q96QS1 320 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM208Q9BTX3 173 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM109Q9BVC6 243 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 WDR54Q9H977 334 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 HES4Q9HCC6 221 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 HRASLSQ9HDD0 168 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPR84Q9NQS5 396 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TET1Q8NFU7 2136 aa-0.77□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SBF1O95248 1867 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TANC1Q9C0D5 1861 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 ROBO3Q96MS0 1386 aa-0.78□□□□□ -2.53
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