RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482086.5

PCCB-215, Transcript of propionyl-CoA carboxylase subunit beta, human

TSL 3 BASIC

Gene PCCB, Length 1,436 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCCB-215	ENST00000482086		A0A1B0GUS0	222 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	HAX1	O00165	279 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	MB	P02144	154 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	OR10J1	P30954	320 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	RAB5C	P51148	216 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	RUNX1	Q01196	453 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	RSG1	Q9BU20	258 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	IGLC1	P0CG04	106 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	LINC01006	Q8NI28	216 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	TMED6	Q8WW62	240 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	TSPAN15	O95858	294 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	IFITM2	Q01629	132 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	RNF141	Q8WVD5	230 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	KLK15	Q9H2R5	256 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	RGS13	O14921	159 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	SULT1A2	P50226	295 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	B2M	P61769	119 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086		Q6ZRG5	221 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	CUBN	O60494	3623 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	CLEC3B	P05452	202 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	RAB14	P61106	215 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	PRR20E	P86478	221 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	PRR20C	P86479	221 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	PRR20D	P86480	221 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	PRR20B	P86481	221 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	PRR20A	P86496	221 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	DEFA5	Q01523	94 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	ZNF616	Q08AN1	781 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	STPG3	Q8N7X2	389 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	RNF114	Q9Y508	228 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086		S4R3C0	116 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PCCB-215	ENST00000482086	OR2T8	A6NH00	312 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086		F8W735	103 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	TGOLN2	O43493	480 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	TOMM40	O96008	361 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	IGKV1-17	P01599	117 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	IGHV3-23	P01764	117 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	CTSG	P08311	255 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	RD3L	P0DJH9	198 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	M6PR	P20645	277 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	GPR183	P32249	361 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	TIGIT	Q495A1	244 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	MIC13	Q5XKP0	118 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	S100A7A	Q86SG5	101 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086		Q8WTZ3	238 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	CCDC140	Q96MF4	163 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	PFDN5	Q99471	154 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	LINC00869	P0C866	280 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	S100A7	P31151	101 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	ZNF90	Q03938	601 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	FOXL1	Q12952	345 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
PCCB-215	ENST00000482086	RNF2	Q99496	336 aa		11.32	□□□□□ -0.6

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