RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 TSSK6Q9BXA6 273 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 ANGPT4Q9Y264 503 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF337Q9Y3M9 751 aa3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 TNCP24821 2201 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A1B0GVY2 172 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A1B0GXF2 115 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 TRAPPC13A5PLN9 417 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 NAP1L6A6NFF2 107 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM210A6NLX4 147 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 FAAHO00519 579 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR171O14626 319 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 OR1I1O60431 355 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 STK16O75716 305 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 YIF1AO95070 293 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 MPC2O95563 127 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 LY6G6CO95867 125 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 APOC3P02656 99 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 OR4A8P0C604 315 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 SMIM6P0DI80 62 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF823P16415 610 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 CDKN2CP42773 168 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 AP3S2P59780 193 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 RAB8AP61006 207 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 C12orf73Q69YU5 71 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 MED27Q6P2C8 311 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 CLEC19AQ6UXS0 136 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 SSX8Q7RTT4 187 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 STX12Q86Y82 276 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 SBSPONQ8IVN8 264 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM86BQ8N661 226 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 OR5T1Q8NG75 326 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 OR8J2Q8NGG1 315 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 OR5W2Q8NH69 310 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 COQ8AQ8NI60 647 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 CD200R1Q8TD46 325 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 ASB13Q8WXK3 278 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 NEURL3Q96EH8 262 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 MRAP2Q96G30 205 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 SMIM8Q96KF7 97 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 PGLYRP3Q96LB9 341 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 AICDAQ9GZX7 198 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 IFI27L2Q9H2X8 130 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 TPT1P8Q9HAU6 139 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 ENPP4Q9Y6X5 453 aa3.64□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 C17orf51A8MQB3 221 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 HMSDA8MTL9 139 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 C5orf58C9J3I9 102 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 LRRN3E7EW58 273 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 H0YJW9 148 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 TCAPO15273 167 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 PDYNP01213 254 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 CLPSP04118 112 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 NMBP08949 121 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 UBBP0CG47 229 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 S100PP25815 95 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 IL3RAP26951 378 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 S100A11P31949 105 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 PSMB2P49721 201 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 GDI2P50395 445 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 CLDN12P56749 244 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM33P57088 247 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 RPS25P62851 125 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 DEFA5Q01523 94 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 SYCNQ0VAF6 134 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 EBPQ15125 230 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 ACTBL2Q562R1 376 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 ELP2Q6IA86 826 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 NOXRED1Q6NXP6 359 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 PRNTQ86SH4 94 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF584Q8IVC4 421 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 OR6V1Q8N148 313 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 SVBPQ8N300 66 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 C10orf111Q8N326 155 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 PXT1Q8NFP0 134 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 OR4K5Q8NGD3 323 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM203Q969S6 136 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 FMC1Q96HJ9 113 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 RERGLQ9H628 205 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 CA10Q9NS85 328 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 ACER3Q9NUN7 267 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa3.63□□□□□ -1.83
STRADBP1-201ENST00000478954 BABAM2Q9NXR7 383 aa3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.5 ms