RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	OR10J1	P30954	320 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	RAB11A	P62491	216 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	PAFAH1B2	P68402	229 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	COQ8A	Q8NI60	647 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880		Q8WTZ3	238 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	NPIPB3	Q92617	1050 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	C9orf170	A2RU37	121 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	WRB	O00258	174 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	MED6	O75586	246 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	SLC35E1	Q96K37	410 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	RABAC1	Q9UI14	185 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PS18	150 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	ADAP1	O75689	374 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	DFFB	O76075	338 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	IFNA21	P01568	189 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	OR4E1	P0C645	316 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	LRTM2	Q8N967	370 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	MUC7	Q8TAX7	377 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	ZFP92	A6NM28	416 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	SCGB1D2	O95969	90 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV1-17	P01599	117 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	IL4	P05112	153 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	IGLC1	P0CG04	106 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	LYL1	P12980	280 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	DHRS2	Q13268	280 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	LYG2	Q86SG7	212 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	CITED4	Q96RK1	184 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880		H3BP45	60 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	LYRM1	O43325	122 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	SYNGR2	O43760	224 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	CD5	P06127	495 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	RD3L	P0DJH9	198 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	BTC	P35070	178 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	P2RY1	P47900	373 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	APOC4	P55056	127 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF124	Q15973	351 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	C3orf84	H3BNL1	204 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	PITX3	O75364	302 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	11.01	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A6	P12236	298 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	LILRB2	Q8N423	598 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	VSIR	Q9H7M9	311 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	MPTX1	A8MV57	137 aa		11	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	SSSCA1	O60232	199 aa		11	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	STPG3	Q8N7X2	389 aa		11	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		11	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		11	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		11	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		11	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	RYR3	Q15413	4870 aa		11	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	SMCO3	A2RU48	225 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	FAM25E	A8MYX2	175 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	PLA2G10	O15496	165 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	TOMM40	O96008	361 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	FABP1	P07148	127 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	PSG1	P11464	419 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	CRYBB3	P26998	211 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	DEFB131A	P59861	70 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	LYZ	P61626	148 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	10.99	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	OR2F1	Q13607	317 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	GAMT	Q14353	236 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SSR4-208	ENST00000471880	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65

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