RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 C7orf71A4D174 169 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 ZNF785A8K8V0 405 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 LILRA1O75019 489 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 SCTP09683 121 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.35□□□□□ -1.39
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USP54-210ENST00000466048 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.35□□□□□ -1.39
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USP54-210ENST00000466048 CFHR2P36980 270 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 ABHD12Q8N2K0 398 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 OR11H1Q8NG94 326 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 OR11H2Q8NH07 326 aa6.35□□□□□ -1.39
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USP54-210ENST00000466048 H3BUT2 72 aa6.34□□□□□ -1.39
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USP54-210ENST00000466048 Q6AWC8 147 aa6.34□□□□□ -1.39
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USP54-210ENST00000466048 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.34□□□□□ -1.39
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USP54-210ENST00000466048 ATOH7Q8N100 152 aa6.34□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 HARBI1Q96MB7 349 aa6.34□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 SRRM5B3KS81 715 aa6.34□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 M0R1W7 72 aa6.34□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 ATP5LO75964 103 aa6.34□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 UCP1P25874 307 aa6.34□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 CKS2P33552 79 aa6.34□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 ADIPOQQ15848 244 aa6.34□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 MED12LQ86YW9 2145 aa6.34□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 TRIOO75962 3097 aa6.34□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 MLNRO43193 412 aa6.34□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 GZMBP10144 247 aa6.34□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
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USP54-210ENST00000466048 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.34□□□□□ -1.4
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USP54-210ENST00000466048 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.34□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.34□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 COX11Q9Y6N1 276 aa6.34□□□□□ -1.4
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USP54-210ENST00000466048 K7EM74 188 aa6.33□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 CD5LO43866 347 aa6.33□□□□□ -1.4
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USP54-210ENST00000466048 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.33□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 RND2P52198 227 aa6.33□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 RIPPLY3P57055 190 aa6.33□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.33□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.33□□□□□ -1.4
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USP54-210ENST00000466048 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.33□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.33□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.33□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 TMEM178BH3BS89 294 aa6.33□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 MMP23AO75900 390 aa6.33□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 RBP4P02753 201 aa6.33□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 CD55P08174 381 aa6.33□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.33□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 SPANXCQ9NY87 97 aa6.33□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.33□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 RABAC1Q9UI14 185 aa6.33□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 TMEM189A5PLL7 270 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 E7EQL1 145 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 HYPMO75409 117 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 TFPI2P48307 235 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 TNXAQ16473 311 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 AGMATQ9BSE5 352 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 AKAP6Q13023 2319 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 TSPAN13O95857 204 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 CXCL1P09341 107 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 GAGE2BQ13066 116 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 GAGE2EQ4V326 116 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 CENPWQ5EE01 88 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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