RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		13.39	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	C5orf51	A6NDU8	294 aa		13.39	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	SSSCA1	O60232	199 aa		13.39	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	OR10J1	P30954	320 aa		13.39	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		13.39	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		13.39	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	NPIPB3	Q92617	1050 aa		13.39	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	ZNF785	A8K8V0	405 aa		13.38	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902		H3BP45	60 aa		13.38	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	CD81	P60033	236 aa		13.38	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	ID3	Q02535	119 aa		13.38	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		13.38	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		13.38	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		13.38	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	SLC35E1	Q96K37	410 aa		13.38	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	B9D2	Q9BPU9	175 aa		13.38	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902		Q8N1Y9	231 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	ASCL2	Q99929	193 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	SMPX	Q9UHP9	88 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	COL7A1	Q02388	2944 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	IGKV1-17	P01599	117 aa		13.36	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	IL5	P05113	134 aa		13.36	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	IGLC1	P0CG04	106 aa		13.36	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902		Q8WTZ3	238 aa		13.36	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	NEURL2	Q9BR09	285 aa		13.36	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		13.36	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	TUBA4B	Q9H853	241 aa		13.36	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		13.36	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	ZFP92	A6NM28	416 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	CHEK1	O14757	476 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	CD7	P09564	240 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	BMI1	P35226	326 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	GAMT	Q14353	236 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	NPPC	P23582	126 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	SMIM8	Q96KF7	97 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	METTL26	Q96S19	204 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	RNF2	Q99496	336 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
USP19-210	ENST00000465902		L7N2F9	121 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	RD3L	P0DJH9	198 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	VAMP2	P63027	116 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	ST8SIA2	Q92186	375 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	C2orf50	Q96LR7	162 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	RAB40C	Q96S21	281 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	OR11H12	B2RN74	326 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	PRAF2	O60831	178 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	IL4	P05112	153 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PS18	150 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	SMCO3	A2RU48	225 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	TSPAN4	O14817	238 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	TOMM40	O96008	361 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	TFPI2	P48307	235 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	AKR1C1	Q04828	323 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	TCF24	Q7RTU0	167 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	DEFB125	Q8N687	156 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	GOSR2	O14653	212 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	FABP1	P07148	127 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	PSG1	P11464	419 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	BCAP31	P51572	246 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	PAX9	P55771	341 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	S100A10	P60903	97 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	ZNF90	Q03938	601 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	C7orf66	A4D0T2	115 aa		13.29	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	OR4C46	A6NHA9	309 aa		13.29	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902		K7EPK0	472 aa		13.29	□□□□□ -0.28
USP19-210	ENST00000465902	TSC22D2	O75157	780 aa		13.29	□□□□□ -0.28

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