RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462970.5

PSMD4-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 4, human

TSL 5

Gene PSMD4, Length 900 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD4-208	ENST00000462970	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	OR4X1	Q8NH49	305 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	MITD1	Q8WV92	249 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	NPIPB3	Q92617	1050 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	SLC35E1	Q96K37	410 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	GINS3	Q9BRX5	216 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	TUBA4B	Q9H853	241 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	C15orf62	A8K5M9	175 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF785	A8K8V0	405 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	OR10C1	Q96KK4	312 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	B9D2	Q9BPU9	175 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	NEURL2	Q9BR09	285 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	SMCO3	A2RU48	225 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	ZFP92	A6NM28	416 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970		K7EMT4	169 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	CD7	P09564	240 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	C8orf88	P0DMB2	117 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	TFPI2	P48307	235 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970		Q8N1Y9	231 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970		Q8WTZ3	238 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	SMPX	Q9UHP9	88 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970		L7N2F9	121 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	CHEK1	O14757	476 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	IGKV1-17	P01599	117 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	IGLC1	P0CG04	106 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	RD3L	P0DJH9	198 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	NPPC	P23582	126 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	BMI1	P35226	326 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	S100A10	P60903	97 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	VAMP2	P63027	116 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	PRR20E	P86478	221 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	PRR20C	P86479	221 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	PRR20D	P86480	221 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	PRR20B	P86481	221 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	PRR20A	P86496	221 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	ID3	Q02535	119 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	AKR1C1	Q04828	323 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	OR2F1	Q13607	317 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	DEFB125	Q8N687	156 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	ST8SIA2	Q92186	375 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	METTL26	Q96S19	204 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	RNF2	Q99496	336 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	OR11H12	B2RN74	326 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970		J3QL48	77 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	GOSR2	O14653	212 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	IL4	P05112	153 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	IL5	P05113	134 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	BCAP31	P51572	246 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	GAMT	Q14353	236 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	TCF24	Q7RTU0	167 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	C2orf50	Q96LR7	162 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	OR4C46	A6NHA9	309 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PSMD4-208	ENST00000462970		A6NJY4	79 aa		7.21	□□□□□ -1.26

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