RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-222	ENST00000449504	METTL26	Q96S19	204 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	IRGM	A1A4Y4	181 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC17A2	O00624	439 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	UPK1B	O75841	260 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	HPRT1	P00492	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	PRM2	P04554	102 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	FCN2	Q15485	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	GPR107	Q5VW38	600 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM230	Q96A57	120 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM56	Q96MV1	263 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504		M0QYG6	137 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	MFNG	O00587	321 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	CTXN2	P0C2S0	81 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	HLA-DRB4	P13762	266 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	GADD45A	P24522	165 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	NPBWR1	P48145	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	ERVK-16	P61578	105 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	POU2AF1	Q16633	256 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	TPRA1	Q86W33	373 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	OR1P1	Q8NH06	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	OR51H1	Q8NH63	302 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	GFI1	Q99684	422 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	RAB22A	Q9UL26	194 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504		A0A087WTM6	91 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	MYL12B	O14950	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	GABARAP	O95166	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM50A	O95807	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	KRAS	P01116	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	ATP5G1	P05496	136 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	CD1A	P06126	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	CRYBB3	P26998	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	ATP5G3	P48201	142 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	VBP1	P61758	197 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	CATR1	Q13166	79 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	OR5I1	Q13606	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	ESRG	Q1W209	222 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	HES5	Q5TA89	166 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504		Q6ZS49	121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	FCGR1B	Q92637	280 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	LINC00052	Q96N35	136 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	CCDC32	Q9BV29	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504		A0A0J9YY99	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	IL7	P13232	177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	ETV6	P41212	452 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	WNT4	P56705	351 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HDLBP-222	ENST00000449504	CD300C	Q08708	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms