RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444685.1

CBX1-204, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CBX1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-204ENST00000444685 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 DCSTAMPQ9H295 470 aa3.64□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 AAMDCQ9H7C9 122 aa3.64□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 VSIRQ9H7M9 311 aa3.64□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 HSPG2P98160 4391 aa3.64□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 HELTA6NFD8 242 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 CGB1A6NKQ9 187 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 K7EQG2 157 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 SULT1C2O00338 296 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 TNFSF12O43508 249 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 PFDN1O60925 122 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 WBP4O75554 376 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 NUDT3O95989 172 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 HBE1P02100 147 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 DTYMKP23919 212 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 S100A5P33763 92 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 CAMPP49913 170 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 ERHP84090 104 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 WT1-ASQ06250 92 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 DHRS2Q13268 280 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 INSL4Q14641 139 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 TRAM1Q15629 374 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 PSMG4Q5JS54 123 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 FAM222AQ5U5X8 452 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 Q5VSD8 79 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 CNIH2Q6PI25 160 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 TOMM20LQ6UXN7 152 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 LYPD1Q8N2G4 141 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 ZNF485Q8NCK3 441 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 OR1P1Q8NH06 330 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 SECTM1Q8WVN6 248 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 PYDC1Q8WXC3 89 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 BORCS5Q969J3 196 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 TMEM230Q96A57 120 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 MND1Q9BWT6 205 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 ATG5Q9H1Y0 275 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 Q9H8V8 135 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 PRNDQ9UKY0 176 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 KCNK7Q9Y2U2 307 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 OR51B2Q9Y5P1 312 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 V9GY05 133 aa3.63□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 TRAV3A0A0B4J244 114 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 K7EIM0 57 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 PDCD5O14737 125 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 KRASP01116 189 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 APOHP02749 345 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 UCHL1P09936 223 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 C4BPBP20851 252 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 SNCAP37840 140 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 P2RY1P47900 373 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 CLDN12P56749 244 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 BRWD1-AS2P59051 145 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 MSMO1Q15800 293 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 POU2AF1Q16633 256 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 CDNFQ49AH0 187 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 AADACL3Q5VUY0 350 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 ZNF600Q6ZNG1 722 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 FAM24BQ8N5W8 94 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 NANOGP1Q8N7R0 232 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 OR4A16Q8NH70 328 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 CYGBQ8WWM9 190 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 TMEM203Q969S6 136 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 TMEM208Q9BTX3 173 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 SLC5A7Q9GZV3 580 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 MAGT1Q9H0U3 335 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 CCL28Q9NRJ3 127 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 DAPK2Q9UIK4 370 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 ANXA10Q9UJ72 324 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.62□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.61□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa3.61□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 F5H768 121 aa3.61□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 I3L2K1 104 aa3.61□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 RHODO00212 210 aa3.61□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 MT-CO2P00403 227 aa3.61□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 IGLV2-14P01704 120 aa3.61□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 IGHV3-48P01763 117 aa3.61□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 IGKV1-13P0DP09 117 aa3.61□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 M6PRP20645 277 aa3.61□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 S100GP29377 79 aa3.61□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 FCGR2CP31995 323 aa3.61□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 ID1P41134 155 aa3.61□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 GNG2P59768 71 aa3.61□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 DLK1P80370 383 aa3.61□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 SPHARQ15513 63 aa3.61□□□□□ -1.83
CBX1-204ENST00000444685 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
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