RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PRE2 83 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM89A2RUT3 159 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 ADH4P08319 380 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 C1RLQ9NZP8 487 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 METRNQ9UJH8 293 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 HCFC1P51610 2035 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 CUL9Q8IWT3 2517 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PPM0 123 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 MPDU1O75352 247 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF138P52744 262 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 BLNKQ8WV28 456 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 RABAC1Q9UI14 185 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 TMPRSS3P57727 454 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 PCOLCEQ15113 449 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC28Q96AY4 2481 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 IGFBP2P18065 325 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZR03 302 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 TEX45Q8NA69 505 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00479Q96M42 142 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 KNTC1P50748 2209 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXC1Q12948 553 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 CEACAM16Q2WEN9 425 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC29Q8WV35 223 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2V2Q96R30 315 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2H1Q9GZK4 316 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 HIGD1CA8MV81 97 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 GGTLC3B5MD39 225 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 FABP2P12104 132 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 RASL11AQ6T310 242 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 ACP7Q6ZNF0 438 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.86□□□□□ -1.31
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RABGEF1-203ENST00000439720 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.86□□□□□ -1.31
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RABGEF1-203ENST00000439720 VWC2LB2RUY7 222 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 RS1O15537 224 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 THBDP07204 575 aa6.85□□□□□ -1.31
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RABGEF1-203ENST00000439720 GUSBP1Q15486 140 aa6.85□□□□□ -1.31
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RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 PEMTQ9UBM1 199 aa6.85□□□□□ -1.31
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RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF137PP52743 207 aa6.85□□□□□ -1.31
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RABGEF1-203ENST00000439720 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.85□□□□□ -1.31
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RABGEF1-203ENST00000439720 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 FRYQ5TBA9 3013 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 NCR2O95944 276 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 FA2HQ7L5A8 372 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 MRAP2Q96G30 205 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 IMMP1LQ96LU5 166 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXB1Q99853 325 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.84□□□□□ -1.31
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