RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 IFNA1P01562 189 aa7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 CD99P14209 185 aa7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 PPIFP30405 207 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 TAS2R45P59539 299 aa7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 BLCAPP62952 87 aa7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 SLC35B1P78383 322 aa7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 NDPQ00604 133 aa7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 ATP5G2Q06055 141 aa7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 FBLN7Q53RD9 439 aa7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 COMMD7Q86VX2 200 aa7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 Q8N2B8 174 aa7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 STPG3Q8N7X2 389 aa7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 Q8WTZ3 238 aa7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.53□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 MFSD2BA6NFX1 497 aa7.53□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 CXorf1O96002 111 aa7.53□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 IGLC1P0CG04 106 aa7.53□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 RD3LP0DJH9 198 aa7.53□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 APELAP0DMC3 54 aa7.53□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 MIC13Q5XKP0 118 aa7.53□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.53□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.53□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 RAB24Q969Q5 203 aa7.53□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 FAM210AQ96ND0 272 aa7.53□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.53□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 ITPR3Q14573 2671 aa7.53□□□□□ -1.2
HDLBP-211ENST00000425989 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.52□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa7.52□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 LINC01548A6NM66 108 aa7.52□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 HYPMO75409 117 aa7.52□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 OR2J3O76001 311 aa7.52□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 YIF1AO95070 293 aa7.52□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 NDUFB8O95169 186 aa7.52□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 TOMM40O96008 361 aa7.52□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 IGLV1-40P01703 118 aa7.52□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 IGHG4P01861 327 aa7.52□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 CRYBA1P05813 215 aa7.52□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 ELANEP08246 267 aa7.52□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 RAB9AP51151 201 aa7.52□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 ELLP55199 621 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 RHOGP84095 191 aa7.52□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 ECSCRQ19T08 205 aa7.52□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 KHDC3LQ587J8 217 aa7.52□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.52□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.52□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 CITED4Q96RK1 184 aa7.52□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 FUT9Q9Y231 359 aa7.52□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 G3V318 75 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 COX7A2P2O60397 106 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 ATP6V1G1O75348 118 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 OR2C1O95371 312 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 LY6G6DO95868 133 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 TRGV3P03979 118 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 CD5P06127 495 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 OR5G3P0C626 314 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 STAG3L2P0CL84 134 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 STAG3L3P0CL85 134 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 C8orf88P0DMB2 117 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 SRD5A1P18405 259 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 FHITP49789 147 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 GUK1Q16774 197 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 C15orf32Q32M92 178 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 Q56UQ5 140 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 TEX38Q6PEX7 206 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 VSIRQ9H7M9 311 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 MANBALQ9NQG1 85 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 RFNGQ9Y644 331 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 VPS13CQ709C8 3753 aa7.5□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.5□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 IGKV1-17P01599 117 aa7.5□□□□□ -1.21
HDLBP-211ENST00000425989 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms