RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401762.2

RPS3AP23-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 23, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP23, Length 784 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP23-201ENST00000401762 IFITM5A6NNB3 132 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 E7EUB6 86 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 CORTO00230 105 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 UPK2O00526 184 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 RTL8CO15255 209 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 TSHBP01222 138 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 IFNA21P01568 189 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 IFNA17P01571 189 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 IGHV3-23P01764 117 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 CD74P04233 296 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 CTSGP08311 255 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 GNB3P16520 340 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 HLA-DMBP28068 263 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 MFAP4P55083 255 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 RPL30P62888 115 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 OXA1LQ15070 435 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 SLC25A24Q6NUK1 477 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 AHSA2Q719I0 299 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 SPAG16Q8N0X2 631 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 RNF2Q99496 336 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 C20orf24Q9BUV8 137 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 VCXQ9H320 206 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 VSIRQ9H7M9 311 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 TMEM14BQ9NUH8 114 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 ANXA10Q9UJ72 324 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 PRNDQ9UKY0 176 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 PMS2P5A8MQ11 134 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 INS-IGF2F8WCM5 200 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 K7EIM0 57 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 XRCC3O43542 346 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 SNAPC5O75971 98 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 S1PR2O95136 353 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 IFNA10P01566 189 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 OR13C7P0DN81 318 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 MYL9P24844 172 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 CALRP27797 417 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 CBX5P45973 191 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 NPBWR1P48145 328 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 Q56UQ5 140 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 TMEM91Q6ZNR0 172 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 Q6ZR54 194 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 TPRA1Q86W33 373 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 APRG1Q8IVJ8 170 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 CYYR1Q96J86 154 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 TAS2R8Q9NYW2 309 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 TBC1D24Q9ULP9 559 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 SPATA2Q9UM82 520 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 TPRKBQ9Y3C4 175 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 FAT2Q9NYQ8 4349 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 HELTA6NFD8 242 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 ST8SIA3O43173 380 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 GNG7O60262 68 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 YIF1AO95070 293 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 PPYP01298 95 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 SPART-AS1P0CW21 52 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 RBMY1CP0DJD4 496 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 IGKV1-13P0DP09 117 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 RAB3BP20337 219 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 F2RP25116 425 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 S100GP29377 79 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 GNRHRP30968 328 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 ALDH3B2P48448 385 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 GNG2P59768 71 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 DEFB131AP59861 70 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 RPS25P62851 125 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 ERHP84090 104 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 WT1-ASQ06250 92 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 PLA2G7Q13093 441 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 INSL4Q14641 139 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 CDNFQ49AH0 187 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 OR2B11Q5JQS5 317 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 SAMD13Q5VXD3 122 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 MZT2BQ6NZ67 158 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 LPCAT3Q6P1A2 487 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 ZNF600Q6ZNG1 722 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 TCF24Q7RTU0 167 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 CMTM1Q8IZ96 169 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 C15orf53Q8NAA6 179 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS3AP23-201ENST00000401762 OR13F1Q8NGS4 319 aa3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms