RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395705.3

CTBP2-204, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 3

Gene CTBP2, Length 580 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-204	ENST00000395705	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	CENPX	A8MT69	81 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	SLC25A6	P12236	298 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	LYG2	Q86SG7	212 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	NPIPB3	Q92617	1050 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	VSIR	Q9H7M9	311 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705		U3KQ87	197 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	SLC25A4	P12235	298 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	OR10J1	P30954	320 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	TFPI2	P48307	235 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF124	Q15973	351 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	ACY3	Q96HD9	319 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	GINS3	Q9BRX5	216 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	DFFB	O76075	338 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	C4orf46	Q504U0	113 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	TCF24	Q7RTU0	167 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	SPATA25	Q9BR10	227 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	WRB	O00258	174 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	IFNA4	P05014	189 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	LYST	Q99698	3801 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	CCDC32	Q9BV29	185 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CTBP2-204	ENST00000395705	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	SYNGR2	O43760	224 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	TCRB	P04435	133 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	CRYBB3	P26998	211 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	GAMT	Q14353	236 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	NOXA1	Q86UR1	476 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	RYR3	Q15413	4870 aa		12.44	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	OR4C46	A6NHA9	309 aa		12.44	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	PRSS46	E5RG02	174 aa		12.44	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705		H3BP45	60 aa		12.44	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	NPPC	P23582	126 aa		12.44	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	12.44	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		12.44	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	COQ8A	Q8NI60	647 aa		12.44	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	METTL26	Q96S19	204 aa		12.44	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		12.44	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		12.44	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	MED6	O75586	246 aa		12.43	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	TOMM40	O96008	361 aa		12.43	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	PSG1	P11464	419 aa		12.43	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	ID3	Q02535	119 aa		12.43	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF90	Q03938	601 aa		12.43	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	MITD1	Q8WV92	249 aa		12.43	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		12.43	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		12.43	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		12.43	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	NUDT15	Q9NV35	164 aa		12.43	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705		U3KQE9	123 aa		12.43	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		12.42	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	CCS	O14618	274 aa		12.42	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	IL4	P05112	153 aa		12.42	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	P2RY1	P47900	373 aa		12.42	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	IFITM3	Q01628	133 aa		12.42	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		12.42	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		12.42	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705		Q8WTZ3	238 aa		12.42	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	S100Z	Q8WXG8	99 aa		12.42	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	SLC35E1	Q96K37	410 aa		12.42	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		12.42	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	SCGB2A1	O75556	95 aa		12.41	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	CCNK	O75909	580 aa		12.41	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	RD3L	P0DJH9	198 aa		12.41	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	RAB11A	P62491	216 aa		12.41	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		12.41	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		12.41	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	TENM2	Q9NT68	2774 aa		12.41	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	ZFP92	A6NM28	416 aa		12.4	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	SSSCA1	O60232	199 aa		12.4	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	SCGB1D2	O95969	90 aa		12.4	□□□□□ -0.42
CTBP2-204	ENST00000395705	IFNA21	P01568	189 aa		12.4	□□□□□ -0.42

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