RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369838.5

SH3BGRL2-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL2, Length 4,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SPSB4Q96A44 273 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TBX15Q96SF7 602 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GCHFRP30047 84 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SULT1A2P50226 295 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TFF3Q07654 80 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 COX19Q49B96 90 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PAX8Q06710 450 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 VAMP3Q15836 100 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZNF600Q6ZNG1 722 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RNF144BQ7Z419 303 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NACAE9PAV3 2078 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TNFSF13O75888 250 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RIPPLY3P57055 190 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KIAA1644Q3SXP7 199 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RNF125Q96EQ8 232 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CD55P08174 381 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 OR4C46A6NHA9 309 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PRSS2P07478 247 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GCGP01275 180 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZNF688P0C7X2 276 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 HERPUD1Q15011 391 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CACNG8Q8WXS5 425 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TNFRSF14Q92956 283 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 C19orf24Q9BVV8 132 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 HLA-DRB1P01911 266 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TRGC1P0CF51 173 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PSMG4Q5JS54 123 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PROK2Q9HC23 129 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 LINC00205P59089 165 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 WIPF3A6NGB9 483 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ELOBQ15370 118 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DHRS11Q6UWP2 260 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 AQP10Q96PS8 301 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TXNDC17Q9BRA2 123 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 EML5Q05BV3 1969 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PSMB2P49721 201 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FBLN7Q53RD9 439 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TMEM97Q5BJF2 176 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MINOS1Q5TGZ0 78 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TEX38Q6PEX7 206 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NDUFS8O00217 210 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NUDT3O95989 172 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 C19orf35Q6ZS72 473 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RNF126Q9BV68 326 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 A0A0A6YYD4 124 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 AREGP15514 252 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PRTN3P24158 256 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FAM71F2Q6NXP2 309 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PCNX3Q9H6A9 2034 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 C15orf61A6NNL5 157 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 H0YIZ8 118 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 C5orf64Q2M2E5 130 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZNF343Q6P1L6 599 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TMEM144Q7Z5S9 345 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NRGNQ92686 78 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GAFA1Q96PS6 74 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KIR2DL4Q99706 377 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RARRES2Q99969 163 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZNRD1Q9P1U0 126 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TRANK1O15050 2925 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 B4DEV8 164 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CD7P09564 240 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RND3P61587 244 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MIR17HGQ75NE6 70 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 QRFPP83859 136 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PRSS8Q16651 343 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RNF114Q9Y508 228 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FAM89BQ8N5H3 189 aa9.9□□□□□ -0.83
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MPZP25189 248 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ASIPP42127 132 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NDPQ00604 133 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CENPWQ5EE01 88 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms