RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 BSXQ3C1V8 233 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 LINC00299Q6ZSB3 139 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 LGI3Q8N145 548 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 CENPSQ8N2Z9 138 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 LRTM2Q8N967 370 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF414Q96IQ9 312 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDCD10Q9BUL8 212 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 C21orf62Q9NYP8 219 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 PEMTQ9UBM1 199 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 SHPKQ9UHJ6 478 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 FLVCR2Q9UPI3 526 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM213A2RRL7 107 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 IZUMO1RA6ND01 250 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 C2orf70A6NJV1 201 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 CENPXA8MT69 81 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 TGOLN2O43493 480 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 MT-CO2P00403 227 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGHV3-48P01763 117 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 SULT1A3P0DMM9 295 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 SULT1A4P0DMN0 295 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 GP9P14770 177 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 SRPXP78539 464 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 SMCO1Q147U7 214 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 DEFB121Q5J5C9 76 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM90A2PQ658T7 463 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLET1Q6UQ28 207 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 CACNG8Q8WXS5 425 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 ATP6V0BQ99437 205 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 CHRDL1Q9BU40 450 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCDC32Q9BV29 185 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 PTTG2Q9NZH5 202 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 C9orf170A2RU37 121 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 A8MWP6 167 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 LYRM1O43325 122 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 PITX3O75364 302 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 CTSGP08311 255 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 FOLR2P14207 255 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 SNCAP37840 140 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 MFAP4P55083 255 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 TNFRSF9Q07011 255 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM106AQ4KMX7 169 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 Q56UQ5 140 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPSB3Q6PJ21 355 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 UBAC2Q8NBM4 344 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM170AQ8WVE7 144 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 S100ZQ8WXG8 99 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM190Q8WZ59 177 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 TXN2Q99757 166 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 ENY2Q9NPA8 101 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 BATF3Q9NR55 127 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 HSPB7Q9UBY9 170 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 TGP01266 2768 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 COL7A1Q02388 2944 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 A0A1B0GU03 582 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF320A2RRD8 509 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 CEBPZOSA8MTT3 80 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 CORTO00230 105 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 NDUFA4O00483 81 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR4E1P0C645 316 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 C8orf88P0DMB2 117 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC25A6P12236 298 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 CBLN1P23435 193 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 HTR2BP41595 481 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 DHRS2Q13268 280 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 DEFB114Q30KQ6 69 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 C2orf83Q53S99 150 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 GGNBP1Q5YKI7 109 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 LYG2Q86SG7 212 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR2K2Q8NGT1 345 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 B9D2Q9BPU9 175 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 C20orf85Q9H1P6 137 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 RBKSQ9H477 322 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 CACFD1Q9UGQ2 172 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 MLXQ9UH92 298 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBC1D24Q9ULP9 559 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 SELENOKQ9Y6D0 94 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 MPTX1A8MV57 137 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 GNG7O60262 68 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 ADAP1O75689 374 aa5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms