RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 TRGV9Q99603 122 aa16.59■□□□□ 0.25
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KCNQ1-202ENST00000335475 SSX2Q16385 188 aa16.58■□□□□ 0.25
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KCNQ1-202ENST00000335475 CBLN4Q9NTU7 201 aa16.56■□□□□ 0.24
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KCNQ1-202ENST00000335475 LINC00479Q96M42 142 aa16.54■□□□□ 0.24
KCNQ1-202ENST00000335475 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa16.54■□□□□ 0.24
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KCNQ1-202ENST00000335475 LINC00310P59036 64 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 ARF6P62330 175 aa16.51■□□□□ 0.23
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KCNQ1-202ENST00000335475 M0R1W7 72 aa16.5■□□□□ 0.23
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KCNQ1-202ENST00000335475 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 DPM3Q9P2X0 92 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 SNURFLB1AK76 121 aa16.49■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 HYPMO75409 117 aa16.49■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 GNG5P63218 68 aa16.49■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 GNB1LQ9BYB4 327 aa16.49■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 TRAV34A0A0B4J273 112 aa16.48■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 MMDQ15546 238 aa16.48■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 FBLN7Q53RD9 439 aa16.48■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 DTX2Q86UW9 622 aa16.48■□□□□ 0.23
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