RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 A0A087WWC5 75 aa14.13□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 TRAV40A0A0B4J280 105 aa14.13□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 K7EIM0 57 aa14.13□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 MSMBP08118 114 aa14.13□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 OR10J4P0C629 311 aa14.13□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 TAS2R45P59539 299 aa14.13□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 HIST1H2BAQ96A08 127 aa14.13□□□□□ -0.15
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ACTB-201ENST00000331789 RNF2Q99496 336 aa14.13□□□□□ -0.15
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ACTB-201ENST00000331789 NPIPB5A8MRT5 1133 aa14.11□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 B4DEV8 164 aa14.11□□□□□ -0.15
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ACTB-201ENST00000331789 SCO2A0A1W2PP80 73 aa14.11□□□□□ -0.15
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ACTB-201ENST00000331789 OR1L6Q8NGR2 347 aa14.11□□□□□ -0.15
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ACTB-201ENST00000331789 VPS13CQ709C8 3753 aa14.11□□□□□ -0.15
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ACTB-201ENST00000331789 LINC00305Q7Z4B0 112 aa14.1□□□□□ -0.15
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ACTB-201ENST00000331789 A0A0U1RQK1 487 aa14.09□□□□□ -0.15
ACTB-201ENST00000331789 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
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ACTB-201ENST00000331789 B4DSR2 109 aa14.09□□□□□ -0.15
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ACTB-201ENST00000331789 TMEM219Q86XT9 240 aa14.08□□□□□ -0.16
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ACTB-201ENST00000331789 SSX3Q99909 188 aa14.07□□□□□ -0.16
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ACTB-201ENST00000331789 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa14.07□□□□□ -0.16
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ACTB-201ENST00000331789 FBN2P35556 2912 aa14.06□□□□□ -0.16
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ACTB-201ENST00000331789 ATP6V0E1O15342 81 aa14.05□□□□□ -0.16
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ACTB-201ENST00000331789 C16orf82Q7Z2V1 217 aa14.05□□□□□ -0.16
ACTB-201ENST00000331789 C5orf56Q8N8D9 126 aa14.05□□□□□ -0.16
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ACTB-201ENST00000331789 Q8WTZ3 238 aa14.05□□□□□ -0.16
ACTB-201ENST00000331789 MLXQ9UH92 298 aa14.05□□□□□ -0.16
ACTB-201ENST00000331789 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa14.05□□□□□ -0.16
ACTB-201ENST00000331789 GGTLC3B5MD39 225 aa14.05□□□□□ -0.16
ACTB-201ENST00000331789 OR2J3O76001 311 aa14.05□□□□□ -0.16
ACTB-201ENST00000331789 RD3LP0DJH9 198 aa14.05□□□□□ -0.16
ACTB-201ENST00000331789 FOLR2P14207 255 aa14.05□□□□□ -0.16
ACTB-201ENST00000331789 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
ACTB-201ENST00000331789 ECSCRQ19T08 205 aa14.05□□□□□ -0.16
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