RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 VSIRQ9H7M9 311 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 RETNQ9HD89 108 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBQLN2Q9UHD9 624 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM90A26D6RGX4 464 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4E1P0C645 316 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHRS2Q13268 280 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 ETFRF1Q6IPR1 90 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 LYG2Q86SG7 212 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 LYRM1O43325 122 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAP1O75689 374 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 IAPPP10997 89 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10J1P30954 320 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNPY1Q3B7I2 92 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 LILRB2Q8N423 598 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACY3Q96HD9 319 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 A6NHS1 94 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 BMI1P35226 326 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00299Q6ZSB3 139 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCF24Q7RTU0 167 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPIPB3Q92617 1050 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC32Q9BV29 185 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 GGTLC1Q9BX51 225 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFNA4P05014 189 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRYBB3P26998 211 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 C4orf46Q504U0 113 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 COQ8AQ8NI60 647 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 METTL26Q96S19 204 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM110AQ9BQ89 295 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGT1Q9H0U3 335 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 C20orf85Q9H1P6 137 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 EDA2RQ9HAV5 297 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 MPTX1A8MV57 137 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYNGR2O43760 224 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 MED6O75586 246 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 DFFBO76075 338 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPPCP23582 126 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 TFPI2P48307 235 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOMM40O96008 361 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD5P06127 495 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 GBGT1Q8N5D6 347 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q8WTZ3 238 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM231Q9H6L2 316 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PS18 150 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 GAMTQ14353 236 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 MUC7Q8TAX7 377 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC35E1Q96K37 410 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 MS4A6AQ9H2W1 248 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAP6D1Q9H9H5 199 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 U3KQE9 123 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 STARD9Q9P2P6 4700 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 C3orf84H3BNL1 204 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 WRBO00258 174 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCRBP04435 133 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL4P05112 153 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 P2RY1P47900 373 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB11AP62491 216 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4D5Q8NGN0 318 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 MITD1Q8WV92 249 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 S100ZQ8WXG8 99 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRSS46E5RG02 174 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFNA21P01568 189 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 RD3LP0DJH9 198 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSG1P11464 419 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 ID3Q02535 119 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF124Q15973 351 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 APRG1Q8IVJ8 170 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D24Q9ULP9 559 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAV6A0A075B6T7 132 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAV2A0A0B4J234 112 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 H3BP45 60 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL11P62913 178 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAFAH1B2P68402 229 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 WFDC3Q8IUB2 231 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM24BQ8N5W8 94 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUDT15Q9NV35 164 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTTG2Q9NZH5 202 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFP92A6NM28 416 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPP30P78346 268 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF90Q03938 601 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPANXN5Q5MJ07 72 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLMPQ8WWB7 406 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRAMD2BQ96HH9 432 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 RYR3Q15413 4870 aa14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms