RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 SPIN2AQ99865 258 aa13.14□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa13.14□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 NABP2Q9BQ15 211 aa13.14□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa13.13□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 G3V4G9 280 aa13.13□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 PRTN3P24158 256 aa13.13□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 SFRP2Q96HF1 295 aa13.13□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 H0YJW9 148 aa13.13□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 TOX4O94842 621 aa13.13□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 P0C879 139 aa13.13□□□□□ -0.31
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CHTF18-202ENST00000317063 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 26.9
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CHTF18-202ENST00000317063 IGLC3P0DOY3 106 aa13.12□□□□□ -0.31
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CHTF18-202ENST00000317063 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa13.12□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 SIRPDQ9H106 197 aa13.12□□□□□ -0.31
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CHTF18-202ENST00000317063 RPS16P62249 146 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 SPSB3Q6PJ21 355 aa13.12□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 CACNG8Q8WXS5 425 aa13.12□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM140Q9NV12 185 aa13.12□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 RBP4P02753 201 aa13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 AZU1P20160 251 aa13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 ACTL10Q5JWF8 245 aa13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 C8orf31Q8N9H6 132 aa13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 ZDHHC16Q969W1 377 aa13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 INSIG2Q9Y5U4 225 aa13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 FOXH1O75593 365 aa13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 CTRLP40313 264 aa13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 TCF24Q7RTU0 167 aa13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 OR5AN1Q8NGI8 311 aa13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 RPEQ96AT9 228 aa13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 ADTRPQ96IZ2 230 aa13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 HSPB9Q9BQS6 159 aa13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 PYGO2Q9BRQ0 406 aa13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF586Q9NXT0 402 aa13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 ITPR3Q14573 2671 aa13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 C5orf64Q2M2E5 130 aa13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 DEFB113Q30KQ7 82 aa13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM41BQ5BJD5 291 aa13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 DYNAPQ8N1N2 210 aa13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 OR4B1Q8NGF8 309 aa13.11□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 MT-CO2P00403 227 aa13.1□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 CNTFRP26992 372 aa13.1□□□□□ -0.31
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CHTF18-202ENST00000317063 RAB11AP62491 216 aa13.1□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 RTL8BQ17RB0 113 aa13.1□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 GPR157Q5UAW9 335 aa13.1□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 NOTCH2Q04721 2471 aa13.1□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa13.1□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 OR2T8A6NH00 312 aa13.1□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 RNF223E7ERA6 249 aa13.1□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 CKS1BP61024 79 aa13.1□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 ERVK-16P61578 105 aa13.1□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 GTSF1LQ9H1H1 148 aa13.1□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa13.09□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 GPR137BO60478 399 aa13.09□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 CST7O76096 145 aa13.09□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 USF1P22415 310 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 HTR1DP28221 377 aa13.09□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF137PP52743 207 aa13.09□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 OR11H6Q8NGC7 330 aa13.09□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 HARBI1Q96MB7 349 aa13.09□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 KIAA1456Q9P272 454 aa13.09□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa13.09□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 LY6LH3BQJ8 138 aa13.09□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 SYNGR2O43760 224 aa13.09□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 APOA2P02652 100 aa13.09□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 TSPOP30536 169 aa13.09□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 KIR2DS2P43631 304 aa13.09□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 P2RY1P47900 373 aa13.09□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 BTF3L4Q96K17 158 aa13.09□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa13.09□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 C11orf1Q9H5F2 150 aa13.09□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 CRYGCP07315 174 aa13.08□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 IL3RAP26951 378 aa13.08□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM177Q53S58 311 aa13.08□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM217Q8N7C4 229 aa13.08□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa13.08□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 OR4A16Q8NH70 328 aa13.08□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 CMTM2Q8TAZ6 248 aa13.08□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
CHTF18-202ENST00000317063 IGSF23A1L1A6 192 aa13.08□□□□□ -0.32
CHTF18-202ENST00000317063 SLC25A6P12236 298 aa13.08□□□□□ -0.32
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