RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa16.75■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 MBPP02686 304 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 DEFA1P59665 94 aa16.75■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 DEFA3P59666 94 aa16.75■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 IL15RAQ13261 267 aa16.75■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 GAMTQ14353 236 aa16.75■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 GSKIPQ9P0R6 139 aa16.75■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa16.74■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 PMS2P5A8MQ11 134 aa16.74■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 OR10J1P30954 320 aa16.74■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 SPANXN5Q5MJ07 72 aa16.74■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 SMIM8Q96KF7 97 aa16.74■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa16.74■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa16.73■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa16.73■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 H3BP45 60 aa16.73■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 CHEK1O14757 476 aa16.73■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 APOHP02749 345 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 RAB11AP62491 216 aa16.73■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 OR1S2Q8NGQ3 325 aa16.73■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 ACY3Q96HD9 319 aa16.73■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 SNRPGP15A8MWD9 76 aa16.72■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 SSSCA1O60232 199 aa16.72■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 LILRB2Q8N423 598 aa16.72■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 C2orf50Q96LR7 162 aa16.72■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 B9D2Q9BPU9 175 aa16.72■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 C11orf1Q9H5F2 150 aa16.72■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 PSENENQ9NZ42 101 aa16.72■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa16.71■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 TRAV25A0A0B4J276 109 aa16.71■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 FAM25EA8MYX2 175 aa16.71■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 SCGB1D2O95969 90 aa16.71■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 CD7P09564 240 aa16.71■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 RPP30P78346 268 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 RNF2Q99496 336 aa16.71■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa16.71■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa16.7■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 C7orf66A4D0T2 115 aa16.7■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 C5orf51A6NDU8 294 aa16.7■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 PRAF2O60831 178 aa16.7■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 CCNKO75909 580 aa16.7■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 FAM90A2PQ658T7 463 aa16.7■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa16.7■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 RAB40CQ96S21 281 aa16.7■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 VSIRQ9H7M9 311 aa16.7■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 C19orf73Q9NVV2 129 aa16.7■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa16.7■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa16.7■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 A8MZ25 164 aa16.7■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 K7EPK0 472 aa16.7■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa16.7■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 TAS2R30P59541 319 aa16.7■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 GUCA2BQ16661 112 aa16.7■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 TSPAN4O14817 238 aa16.69■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 CRYBB3P26998 211 aa16.69■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 ST8SIA2Q92186 375 aa16.69■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 NEURL2Q9BR09 285 aa16.69■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 GINS3Q9BRX5 216 aa16.69■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 U3KQE9 123 aa16.69■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 TOMM40O96008 361 aa16.68■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 PSG1P11464 419 aa16.68■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 CD81P60033 236 aa16.68■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 ZNF90Q03938 601 aa16.68■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 GSG1LQ6UXU4 331 aa16.68■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 THAP8Q8NA92 274 aa16.68■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 Q8WTZ3 238 aa16.68■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 SLC35E1Q96K37 410 aa16.68■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 TSC22D2O75157 780 aa16.67■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 SCGB2A1O75556 95 aa16.67■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 SIX6O95475 246 aa16.67■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa16.67■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 RD3LP0DJH9 198 aa16.67■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 ARL16Q0P5N6 197 aa16.67■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 GTSCR1Q86UQ5 136 aa16.67■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa16.66■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 METTL15P1P0C7V9 234 aa16.66■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 NPPCP23582 126 aa16.66■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa16.66■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 WFDC10AQ9H1F0 79 aa16.66■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 RAB32Q13637 225 aa16.65■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa16.65■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 SBSPONQ8IVN8 264 aa16.65■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 TRGV9Q99603 122 aa16.65■□□□□ 0.26
SYF2-201ENST00000236273 ZFP92A6NM28 416 aa16.64■□□□□ 0.25
SYF2-201ENST00000236273 GOSR2O14653 212 aa16.64■□□□□ 0.25
SYF2-201ENST00000236273 DFFBO76075 338 aa16.64■□□□□ 0.25
SYF2-201ENST00000236273 PTTG1O95997 202 aa16.64■□□□□ 0.25
SYF2-201ENST00000236273 IL4P05112 153 aa16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms