RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa8.55□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 CLEC7AQ9BXN2 247 aa8.55□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 A0A1W2PS18 150 aa8.55□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 TEX45Q8NA69 505 aa8.55□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 CCL1P22362 96 aa8.55□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 CACNG7P62955 275 aa8.55□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.55□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 OR9G1Q8NH87 305 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 NUP210LQ5VU65 1888 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 KIR3DS1Q14943 382 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 LYZL4Q96KX0 146 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 ID3Q02535 119 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 CDCP2Q5VXM1 449 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 PATE3B3GLJ2 98 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 WBP1LQ9NX94 342 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 VKORC1Q9BQB6 163 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 ZNF497Q6ZNH5 498 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 CFHR5Q9BXR6 569 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 GDF15Q99988 308 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 DCTN5Q9BTE1 182 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 TIAF1O95411 115 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 LHFPL1Q86WI0 220 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 OR13A1Q8NGR1 328 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 DPM2O94777 84 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 FOXL1Q12952 345 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 COQ2Q96H96 371 aa8.54□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 EPDR1Q9UM22 224 aa8.53□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 RFNGQ9Y644 331 aa8.53□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.53□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 ERVK11-1P61568 191 aa8.53□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 EFNB3Q15768 340 aa8.53□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.53□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 OR9G4Q8NGQ1 327 aa8.53□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.53□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa8.53□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 CLEC2AQ6UVW9 174 aa8.53□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 HBDP02042 147 aa8.53□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 LCN12Q6JVE5 192 aa8.53□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 hDV102S1A0JD36 115 aa8.53□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.53□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa8.53□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 LINC01551Q86U37 167 aa8.53□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa8.53□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 ATP6V0BQ99437 205 aa8.53□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 TNFRSF6BO95407 300 aa8.52□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 PF4V1P10720 104 aa8.52□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 FOXC1Q12948 553 aa8.52□□□□□ -1.04
TTL-201ENST00000233336 C15orf61A6NNL5 157 aa8.52□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 AGMATQ9BSE5 352 aa8.52□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 MGST2Q99735 147 aa8.52□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 A0A1W2PRE2 83 aa8.52□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.52□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 PSMB11A5LHX3 300 aa8.52□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 OTORQ9NRC9 128 aa8.52□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 PILRBQ9UKJ0 227 aa8.52□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 AHRRA9YTQ3 701 aa8.52□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.52□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.52□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 J3QW42 95 aa8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 RFPL3SP0C7P2 107 aa8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 ATP5G2Q06055 141 aa8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 RRN3P1Q2M238 152 aa8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 ZNF319Q9P2F9 582 aa8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 TSKUQ8WUA8 353 aa8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 S4R3C0 116 aa8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 LYL1P12980 280 aa8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 PYYP10082 97 aa8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.51□□□□□ -1.05
TTL-201ENST00000233336 Q6ZT83 130 aa8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms