RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4K15	Q8NH41	348 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	STOML3	Q8TAV4	291 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	GALNT14	Q96FL9	552 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	BANF2	Q9H503	90 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	RHOF	Q9HBH0	211 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A0J9YXV3	536 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	C5orf63	A6NC05	138 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	OR6C6	A6NF89	314 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616		M0R233	179 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	TAAR5	O14804	337 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ZG16	O60844	167 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	SIX6	O95475	246 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV1-44	P01699	117 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	PMP2	P02689	132 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	CHTF8	P0CG12	524 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF32	P17041	273 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	PMEL	P40967	661 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	PSG4	Q00888	419 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	GRK1	Q15835	563 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	TTC32	Q5I0X7	151 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF774	Q6NX45	483 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	TERB2	Q8NHR7	220 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	REEP6	Q96HR9	211 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	LITAF	Q99732	161 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	CHST5	Q9GZS9	411 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	CA10	Q9NS85	328 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	TENM4	Q6N022	2769 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRK2	Q5S007	2527 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	SHISA9	B4DS77	424 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616		G3V3Q6	166 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	NRAS	P01111	189 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV2-11	P01706	119 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	CRYGS	P22914	178 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	DTYMK	P23919	212 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ZBTB25	P24278	435 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	COX7A1	P24310	79 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	CD34	P28906	385 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	AGTR1	P30556	359 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	OPRM1	P35372	400 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	RBP2	P50120	134 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	H2BFS	P57053	126 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	DHRS2	Q13268	280 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	RSU1	Q15404	277 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	SSX8	Q7RTT4	187 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	LYG2	Q86SG7	212 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ABHD3	Q8WU67	409 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	BLNK	Q8WV28	456 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	PHB2	Q99623	299 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	COMMD9	Q9P000	198 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		3.65	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	MED12L	Q86YW9	2145 aa		3.65	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	TACC2	O95359	2948 aa		3.65	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		3.65	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A0D9SG52	128 aa		3.65	□□□□□ -1.83

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