RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB11AP62491 216 aa18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 ARL16Q0P5N6 197 aa18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 VWC2Q2TAL6 325 aa18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM217Q8N7C4 229 aa18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 RAX2Q96IS3 184 aa18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 IFNA10P01566 189 aa18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 IFNA5P01569 189 aa18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 SPP1P10451 314 aa18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF141Q8WVD5 230 aa18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00862A6NCI5 91 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC01548A6NM66 108 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 NBR2O15453 112 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 FGF16O43320 207 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 IGKV1D-33P01593 117 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 IGKV1-33P01594 117 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 ERHP84090 104 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC38A11Q08AI6 406 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 CLINT1Q14677 625 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 C2orf83Q53S99 150 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 MED9Q9NWA0 146 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 FNDC10F2Z333 226 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHG2P01859 326 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 NMBP08949 121 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB5CP51148 216 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 SPINK9Q5DT21 86 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC24A4Q8NFF2 622 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM147Q9BVK8 224 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA1456Q9P272 454 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 ACTL6BO94805 426 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 NPY1RP25929 384 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR25Q96S07 402 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 STARD9Q9P2P6 4700 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 NUDT19A8MXV4 375 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 PRSS46E5RG02 174 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 CCL24O00175 119 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 SULT1A2P50226 295 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 DLK1P80370 383 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 LILRB2Q8N423 598 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 TMED6Q8WW62 240 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-216ENST00000628306 CGB1A6NKQ9 187 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 C3orf84H3BNL1 204 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 CNTFRP26992 372 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 MMDQ15546 238 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 C5orf64Q2M2E5 130 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 PVRIGQ6DKI7 326 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 OR8G2PQ6IF36 304 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 COMMD1Q8N668 190 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 SCGB1C1Q8TD33 95 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM170AQ8WVE7 144 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 UQCC1Q9NVA1 299 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 UMAD1C9J7I0 102 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 MYOD1P15172 320 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM11P17152 192 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 SNCAP37840 140 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP18.69■□□□□ 0.582e-6■■■□□ 18.2
CAPNS1-216ENST00000628306 PJVKQ0ZLH3 352 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 HNF4GQ14541 408 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFB136Q30KP8 78 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 LCNL1Q6ZST4 164 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 HINT2Q9BX68 163 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXL15Q9H469 300 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 TPSG1Q9NRR2 321 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 CSMD3Q7Z407 3707 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 SOX15O60248 233 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 CA2P00918 260 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP6V0CP27449 155 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 HES1Q14469 280 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF562Q6V9R5 426 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35E3Q7Z769 313 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF114Q8NC26 417 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 ASCL2Q99929 193 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 TIMM9Q9Y5J7 89 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 E7EUB6 86 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 IFNA4P05014 189 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 SERF2P84101 59 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF152Q8N8N0 203 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 CACNG8Q8WXS5 425 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1B0GW64 132 aa18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 MPDU1O75352 247 aa18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 BLOC1S1P78537 153 aa18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 WT1-ASQ06250 92 aa18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 TNXAQ16473 311 aa18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLC7A0M8Q6 106 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35B1P78383 322 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-216ENST00000628306 PLGLAQ15195 96 aa18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms