RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 OR5B12Q96R08 314 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 CITED1Q99966 193 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 RNF126Q9BV68 326 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 IGSF23A1L1A6 192 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 FAM229AH3BQW9 127 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 K7EIM0 57 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 CST7O76096 145 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 LYL1P12980 280 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 SULT1A1P50225 295 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 MLANAQ16655 118 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 STX12Q86Y82 276 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 CXorf58Q96LI9 332 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF747Q9BV97 191 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 GNB4Q9HAV0 340 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 PRSS46E5RG02 174 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 G3V3Q6 166 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 SLC25A4P12235 298 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 RPL12P30050 165 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 CD69Q07108 199 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 CD300CQ08708 224 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 ARL16Q0P5N6 197 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 Q56UQ5 140 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 ACSM6Q6P461 480 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 LILRB2Q8N423 598 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC140Q96MF4 163 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 SMCO3A2RU48 225 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 OR2T8A6NH00 312 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 PPP5D1E7EU14 171 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 I3L521 148 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 GHRHP01286 108 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 GPR183P32249 361 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 ARL3P36405 182 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 MFAP4P55083 255 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 HBG1P69891 147 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 HBG2P69892 147 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 NHLH2Q02577 135 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 BAXQ07812 192 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 DEFB136Q30KP8 78 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF546Q86UE3 836 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 ACY3Q96HD9 319 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 SLC35E1Q96K37 410 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 A0A087WW49 117 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 F8W735 103 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 EREGO14944 169 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 ARPC5O15511 151 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 GNG7O60262 68 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 PFDN1O60925 122 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 CLN5O75503 358 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 TRBV12-3P01733 135 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 CLEC3BP05452 202 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 S100A11P31949 105 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 NPBWR1P48145 328 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 RND2P52198 227 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 DLK1P80370 383 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 AKR1C1Q04828 323 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 GAMTQ14353 236 aa6.57□□□□□ -1.36
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