RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	SNAPC5	O75971	98 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	PGAM2	P15259	253 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	G6PC	P35575	357 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	SP6	Q3SY56	376 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468		Q56UQ5	140 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM56	Q96MV1	263 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	HINT2	Q9BX68	163 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	C15orf61	A6NNL5	157 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468		I3L2K1	104 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	CDS2	O95674	445 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	CCR6	P51684	374 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	AP3S2	P59780	193 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF114	Q8NC26	417 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC32	Q9BV29	185 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	CSTL1	Q9H114	145 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	NAA60	Q9H7X0	242 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	MPTX1	A8MV57	137 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	NDUFB6	O95139	128 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM187	Q14656	261 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF846	Q147U1	533 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF124	Q15973	351 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	AARD	Q4LEZ3	155 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468		Q6ZRM9	215 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	TXN2	Q99757	166 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	MCUB	Q9NWR8	336 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468		A0A0B4J293	547 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	OR5AC1	P0C628	307 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	MFAP4	P55083	255 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	PRR13	Q9NZ81	148 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	DEDD	O75618	318 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	YIF1A	O95070	293 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	CD5	P06127	495 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	PRCD	Q00LT1	54 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	TRIQK	Q629K1	86 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	MISP3	Q96FF7	219 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	RARRES2	Q99969	163 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	MFF	Q9GZY8	342 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	COPZ2	Q9P299	210 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	B3GALNT1	O75752	331 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	UPK1B	O75841	260 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	MT-CO2	P00403	227 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	ASAH1	Q13510	395 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	VSIR	Q9H7M9	311 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	HERC2	O95714	4834 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	LYRM1	O43325	122 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	TFPI2	P48307	235 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	PPP1R1A	Q13522	171 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	NMS	Q5H8A3	153 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	LRTM2	Q8N967	370 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	OR11H2	Q8NH07	326 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	GNG7	O60262	68 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	DFFB	O76075	338 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV3-48	P01763	117 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	S100G	P29377	79 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	PAFAH1B2	P68402	229 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	TCF24	Q7RTU0	167 aa		10.16	□□□□□ -0.78

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