RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 CFAP54Q96N23 3096 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 TMEM238C9JI98 176 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 CORTO00230 105 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 MGST3O14880 152 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 LIPFP07098 398 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 PRDX2P32119 198 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 OTX2P32243 289 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 MOB3BQ86TA1 216 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 GCSAMQ8N6F7 178 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 VPS25Q9BRG1 176 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 SRRM5B3KS81 715 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 IGKV3-15P01624 115 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 GUSBP1Q15486 140 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 THAP8Q8NA92 274 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 CT55Q8WUE5 264 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 GTSF1Q8WW33 167 aa8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 G3V4G9 280 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 LEPROTL1O95214 131 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 MYOD1P15172 320 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 IGHV1-2P23083 117 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 CT45A1Q5HYN5 189 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 PRR27Q6MZM9 219 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 CT45A3Q8NHU0 189 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 HES7Q9BYE0 225 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 SPRY4Q9C004 299 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 OBP2BQ9NPH6 170 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 PILRBQ9UKJ0 227 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 LTAP01374 205 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 UTF1Q5T230 341 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 PATE2Q6UY27 113 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 CACNA1EQ15878 2313 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 GPR183P32249 361 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 LYSMD4Q5XG99 296 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 OR9G1Q8NH87 305 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 C12orf49Q9H741 205 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 GNG12Q9UBI6 72 aa8.01□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 CBY3A6NI87 242 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 HAX1O00165 279 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 ASPHD1Q5U4P2 390 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 PVRIGQ6DKI7 326 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 CALYQ9NYX4 217 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 CLCF1Q9UBD9 225 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 RNF24Q9Y225 148 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 EYSQ5T1H1 3165 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 H3BRM9 83 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 C3AR1Q16581 482 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 OR1L4Q8NGR5 311 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 LRRC29Q8WV35 223 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 FAM234AQ9H0X4 552 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 GCM1Q9NP62 436 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 DLL1O00548 723 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 FOXE3Q13461 319 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 TMEM30BQ3MIR4 351 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 MDS2Q8NDY4 140 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 ITLN1Q8WWA0 313 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 PAXXQ9BUH6 204 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
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HCG18-242ENST00000602319 C9orf118A6NHY6 69 aa7.99□□□□□ -1.13
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HCG18-242ENST00000602319 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.99□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 SARAFQ96BY9 339 aa7.99□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 FSCN3Q9NQT6 498 aa7.99□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa7.99□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.99□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 EPDR1Q9UM22 224 aa7.99□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 SDK2Q58EX2 2172 aa7.99□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 LHBP01229 141 aa7.99□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 FAM222BQ8WU58 562 aa7.99□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 FMC1Q96HJ9 113 aa7.99□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 JMJD8Q96S16 334 aa7.99□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 RAB9BQ9NP90 201 aa7.99□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.98□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 K7EP34 96 aa7.98□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 IGLV1-44P01699 117 aa7.98□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 PYYP10082 97 aa7.98□□□□□ -1.13
HCG18-242ENST00000602319 PI4KAP42356 2102 aa7.98□□□□□ -1.13
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