RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592597.1

POLR2E-210, Transcript of RNA polymerase II subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene POLR2E, Length 440 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2E-210ENST00000592597 COA4Q9NYJ1 87 aa11.55□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 FBXO7Q9Y3I1 522 aa11.55□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa11.54□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 IGLV2-23P01705 113 aa11.54□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 ERVK-16P61578 105 aa11.54□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 BAXQ07812 192 aa11.54□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 MMDQ15546 238 aa11.54□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 C5orf64Q2M2E5 130 aa11.54□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 OR2C3Q8N628 320 aa11.54□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 DEFB125Q8N687 156 aa11.54□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 GPHA2Q96T91 129 aa11.54□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 WFDC10AQ9H1F0 79 aa11.54□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 DNAH11Q96DT5 4516 aa11.54□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 NUPR2A6NF83 97 aa11.53□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 MSGN1A6NI15 193 aa11.53□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 RRHO14718 337 aa11.53□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 SSSCA1O60232 199 aa11.53□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 HPRT1P00492 218 aa11.53□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 CRYGBP07316 175 aa11.53□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 CAV2P51636 162 aa11.53□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 RPS16P62249 146 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 PSG5Q15238 335 aa11.53□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 ZNF585BQ52M93 769 aa11.53□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa11.53□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 STX12Q86Y82 276 aa11.53□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 OR4S2Q8NH73 311 aa11.53□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 AIFM2Q9BRQ8 373 aa11.53□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 MED9Q9NWA0 146 aa11.53□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 CACNG5Q9UF02 275 aa11.53□□□□□ -0.56
POLR2E-210ENST00000592597 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa11.52□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 FCGR3BO75015 233 aa11.52□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 PITX3O75364 302 aa11.52□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 CNIH1O95406 144 aa11.52□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 CRYZL1O95825 349 aa11.52□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 HLA-DRB1P01911 266 aa11.52□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 TAS2R30P59541 319 aa11.52□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 CD81P60033 236 aa11.52□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP11.52□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 NDPQ00604 133 aa11.52□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 ZNF266Q14584 549 aa11.52□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 IL34Q6ZMJ4 242 aa11.52□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 DMBX1Q8NFW5 382 aa11.52□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 RNF141Q8WVD5 230 aa11.52□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 CLCC1Q96S66 551 aa11.52□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa11.52□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 FBXL17Q9UF56 701 aa11.52□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 SHOXO15266 292 aa11.51□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 SYNGR2O43760 224 aa11.51□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 IGKV1-39P01597 117 aa11.51□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 IGKV1-5P01602 117 aa11.51□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 IGKV1D-39P04432 117 aa11.51□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 UBE2KP61086 200 aa11.51□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 POU2AF1Q16633 256 aa11.51□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 COMMD7Q86VX2 200 aa11.51□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 TEX45Q8NA69 505 aa11.51□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 UBAC2Q8NBM4 344 aa11.51□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 HARBI1Q96MB7 349 aa11.51□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 CYTL1Q9NRR1 136 aa11.51□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 PKD1P98161 4303 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 DFFBO76075 338 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 KRASP01116 189 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 NMBP08949 121 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 CD7P09564 240 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 MED14OSP0DP75 135 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 PRR20EP86478 221 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 PRR20CP86479 221 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 PRR20DP86480 221 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 PRR20BP86481 221 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 PRR20AP86496 221 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 C19orf54Q5BKX5 351 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 OR2B11Q5JQS5 317 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 MAGT1Q9H0U3 335 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 FBXL15Q9H469 300 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 SRD5A3Q9H8P0 318 aa11.5□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 HERC1Q15751 4861 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 A0A0J9YWU9 116 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 ANKRD34BA5PLL1 514 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 S1PR2O95136 353 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 HRASP01112 189 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 NQO2P16083 231 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 TPPP2P59282 170 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 VMA21Q3ZAQ7 101 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 LCN12Q6JVE5 192 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 PPP1R27Q86WC6 154 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 TMEM252Q8N6L7 170 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 OR9G4Q8NGQ1 327 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 OR1S2Q8NGQ3 325 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 SMIM8Q96KF7 97 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 RHOVQ96L33 236 aa11.49□□□□□ -0.57
POLR2E-210ENST00000592597 C11orf1Q9H5F2 150 aa11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.5 ms