RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 MYOD1P15172 320 aa7.44□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 REG1BP48304 166 aa7.44□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 COMPP49747 757 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 PPOXP50336 477 aa7.44□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 PDLIM4P50479 330 aa7.44□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 RPEL1Q2QD12 228 aa7.44□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa7.44□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 THAP8Q8NA92 274 aa7.44□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF114Q8NC26 417 aa7.44□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 SGMS2Q8NHU3 365 aa7.44□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.44□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM18Q96B42 140 aa7.44□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.44□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 DERL1Q9BUN8 251 aa7.44□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 IL36BQ9NZH7 164 aa7.44□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 CTSZQ9UBR2 303 aa7.44□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.44□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 CACNA1AO00555 2505 aa7.44□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 HCFC1P51610 2035 aa7.44□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 DSCAML1Q8TD84 2053 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLV2-23P01705 113 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV2-70P01814 119 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 MT-ND6P03923 174 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 OR10J4P0C629 311 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 CA7P43166 264 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF90Q03938 601 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 CENPWQ5EE01 88 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 PYY3Q5JQD4 70 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 WDR73Q6P4I2 378 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 BEND2Q8NDZ0 799 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 OR8B3Q8NGG8 313 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 PERPQ96FX8 193 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 TIMD4Q96H15 378 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 OR8B2Q96RD0 313 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF5Q99942 180 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNRD1Q9P1U0 126 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 NCOR2Q9Y618 2525 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 HELTA6NFD8 242 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 ENSAO43768 121 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC25A17O43808 307 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 GCGP01275 180 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 TAS2R60P59551 318 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 ERVFC1-1P60608 527 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL15P61313 204 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 PAX2Q02962 417 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 KLRB1Q12918 225 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 MUC15Q8N387 334 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 OR10W1Q8NGF6 305 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 OCC1Q8TAD7 63 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 CHRDL1Q9BU40 450 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 CDIP1Q9H305 208 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 OSTCQ9NRP0 149 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 DSCAMO60469 2012 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 URB1O60287 2271 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00587B1AMM8 73 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 FOXH1O75593 365 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 PKIAP61925 76 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 WT1-ASQ06250 92 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 PRSS8Q16651 343 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 OR5AU1Q8NGC0 362 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 C8orf46Q8TAG6 207 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 RPEQ96AT9 228 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 TRGV9Q99603 122 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 PAXXQ9BUH6 204 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1W2PPI3 338 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 ISLRO14498 428 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 AMBPP02760 352 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 LIPFP07098 398 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 HNF1AP20823 631 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 CRYBB3P26998 211 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 TNXAQ16473 311 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-222ENST00000592408 IQCJQ1A5X6 159 aa7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 146.7 ms