RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 RPRMQ9NS64 109 aa17.94■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 I3L521 148 aa17.93■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 AVPP01185 164 aa17.93■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 TMUB1Q9BVT8 246 aa17.93■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCA2Q9BZC7 2435 aa17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 FSHBP01225 129 aa17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 NPBWR1P48145 328 aa17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 RHOBP62745 196 aa17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 AKIRIN2Q53H80 203 aa17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 ACSM6Q6P461 480 aa17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 THAP8Q8NA92 274 aa17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM116Q8NCL8 245 aa17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 OR1L4Q8NGR5 311 aa17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 TNCP24821 2201 aa17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP17.92■□□□□ 0.461e-6■■■■□ 25.3
CAPNS1-212ENST00000591041 OR10J1P30954 320 aa17.91■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa17.91■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa17.91■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 STPG3Q8N7X2 389 aa17.91■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 NPIPB3Q92617 1050 aa17.91■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 PFDN5Q99471 154 aa17.91■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 TREM1Q9NP99 234 aa17.91■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa17.91■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 APELAP0DMC3 54 aa17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 S100A7P31151 101 aa17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 RND2P52198 227 aa17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 OR4X1Q8NH49 305 aa17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 PIFOQ8TCI5 191 aa17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 TRGV9Q99603 122 aa17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC45A2Q9UMX9 530 aa17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-212ENST00000591041 SEC14L6B5MCN3 397 aa17.89■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 SRP14P37108 136 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 FHITP49789 147 aa17.89■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 TAS2R45P59539 299 aa17.89■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 DEFB112Q30KQ8 113 aa17.89■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM122CQ6P4D5 195 aa17.89■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM219Q86XT9 240 aa17.89■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 BPIFCQ8NFQ6 507 aa17.89■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 OR2T6Q8NHC8 308 aa17.89■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 CD5LO43866 347 aa17.88■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 MFAP4P55083 255 aa17.88■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 LY6EQ16553 131 aa17.88■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 C9orf152Q5JTZ5 239 aa17.88■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 MIC13Q5XKP0 118 aa17.88■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC35E3Q7Z769 313 aa17.88■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM210AQ96ND0 272 aa17.88■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 TXN2Q99757 166 aa17.88■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 TNFRSF19Q9NS68 423 aa17.88■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 PRR20EP86478 221 aa17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 PRR20CP86479 221 aa17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 PRR20DP86480 221 aa17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 PRR20BP86481 221 aa17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 PRR20AP86496 221 aa17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 ECSCRQ19T08 205 aa17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 LCN15Q6UWW0 184 aa17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 VN1R17PQ8TDU5 208 aa17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 GATAD1Q8WUU5 269 aa17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 CR1P17927 2039 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAV41A0A0B4J266 112 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 H3BUA1 57 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 I3L2K1 104 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP6V0E1O15342 81 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 ZP3P21754 424 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 IER3P46695 156 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 PSMB3P49720 205 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 PMS2P11Q13670 270 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 GUK1Q16774 197 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 MANBALQ9NQG1 85 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF24Q9Y225 148 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 RFNGQ9Y644 331 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD34BA5PLL1 514 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 AP4M1O00189 453 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 COX7A2P2O60397 106 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 CLN5O75503 358 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 MFAP2P55001 183 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 NDPQ00604 133 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 Q6YL49 198 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-212ENST00000591041 OR5T1Q8NG75 326 aa17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms