RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 M0QZK8 103 aa5.82□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 PMP2P02689 132 aa5.82□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 IGKV1-16P04430 117 aa5.82□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 CTXN2P0C2S0 81 aa5.82□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 OR5H8P0DN80 308 aa5.82□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 HLA-DMAP28067 261 aa5.82□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 FXYD4P59646 89 aa5.82□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 ACTBP60709 375 aa5.82□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 CDK10Q15131 360 aa5.82□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 OR2B11Q5JQS5 317 aa5.82□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM17Q86X19 198 aa5.82□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa5.82□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF645Q8N7E2 425 aa5.82□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 GDPD1Q8N9F7 314 aa5.82□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 WFDC9Q8NEX5 89 aa5.82□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 LITAFQ99732 161 aa5.82□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 SOSTQ9BQB4 213 aa5.82□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 HSPB9Q9BQS6 159 aa5.82□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 EHFQ9NZC4 300 aa5.82□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 LINC00527Q9UJ94 153 aa5.82□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa5.81□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 MFSD2BA6NFX1 497 aa5.81□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 NBR2O15453 112 aa5.81□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 FGF16O43320 207 aa5.81□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 APOA2P02652 100 aa5.81□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 HRH1P35367 487 aa5.81□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 RPL30P62888 115 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP5.81□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 DEFB121Q5J5C9 76 aa5.81□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 OR5H2Q8NGV7 314 aa5.81□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 DEDD2Q8WXF8 326 aa5.81□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 BORCS5Q969J3 196 aa5.81□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 CCDC32Q9BV29 185 aa5.81□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 FXYD6Q9H0Q3 95 aa5.81□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 FBXL15Q9H469 300 aa5.81□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 CCL28Q9NRJ3 127 aa5.81□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 WASHC3Q9Y3C0 194 aa5.81□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 V9GYH0 126 aa5.81□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 H0Y8G0 127 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 SULT1C2O00338 296 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 PPYP01298 95 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 IGHG2P01859 326 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 RCVRNP35243 200 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 TAS2R46P59540 309 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 KRTAP10-11P60412 298 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 SRPXP78539 464 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 IL18Q14116 193 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 PLGLAQ15195 96 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 SLC35E3Q7Z769 313 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF329Q86UD4 541 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 SLC38A6Q8IZM9 456 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF491Q8N8L2 437 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 NPBQ8NG41 125 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 CLCC1Q96S66 551 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 RASL11BQ9BPW5 248 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 TAS2R8Q9NYW2 309 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 GAB2Q9UQC2 676 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 TENM2Q9NT68 2774 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 GABARAPH6UMI1 98 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 FCN1O00602 326 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 NDUFA3O95167 84 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 CRYZL1O95825 349 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 IGLV2-23P01705 113 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 CD3DP04234 171 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 NDPQ00604 133 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 PSG5Q15238 335 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 C5orf64Q2M2E5 130 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 ZFP69Q49AA0 526 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 FAAP20Q6NZ36 180 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 PDPNQ86YL7 162 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 SMIM4Q8WVI0 70 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 GIMAP1Q8WWP7 306 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 GPR61Q9BZJ8 451 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 SRRQ9GZT4 340 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 MTFP1Q9UDX5 166 aa5.79□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa5.78□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 PSMB11A5LHX3 300 aa5.78□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 C3orf84H3BNL1 204 aa5.78□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 RAMP3O60896 148 aa5.78□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 RBBP9O75884 186 aa5.78□□□□□ -1.48
ATG4D-210ENST00000588972 SLC22A5O76082 557 aa5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.9 ms