RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 FSCN3Q9NQT6 498 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 FOXH1O75593 365 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 ACTL6BO94805 426 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 P01737 135 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 SP9P0CG40 484 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 CT45A6P0DMU7 189 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 CT45A5P0DMU8 189 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 CT45A7P0DMV0 189 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 DEFA4P12838 97 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 NTF3P20783 257 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 HNF1AP20823 631 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 MYCNOSP40205 109 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 COTL1Q14019 142 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 C3AR1Q16581 482 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 NUP35Q8NFH5 326 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF503Q96F45 646 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 HARBI1Q96MB7 349 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 HINT2Q9BX68 163 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 EPDR1Q9UM22 224 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1B0GUS0 222 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 HIGD1CA8MV81 97 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 PATE3B3GLJ2 98 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 LEPROTL1O95214 131 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 PPBPP02775 128 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 CSN1S1P47710 185 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF134P52741 427 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 SEC11AP67812 179 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 RHOGP84095 191 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 RIGQ13278 110 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 LTC4SQ16873 150 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 TPRX1Q8N7U7 411 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 TEX45Q8NA69 505 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 NUP37Q8NFH4 326 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 NUDT11Q96G61 164 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 RNF5Q99942 180 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 MLST8Q9BVC4 326 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 OTORQ9NRC9 128 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A0C4DFX4 3053 aa6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 C2orf70A6NJV1 201 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 K7ERU9 68 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 CHEK1O14757 476 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 TCF21O43680 179 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 CD5LO43866 347 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 SCGB2A1O75556 95 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 LTAP01374 205 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 CRYGCP07315 174 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 CEACAM3P40198 252 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 PCP4P48539 62 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 SLAQ13239 276 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 FXYD3Q14802 87 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 TNXAQ16473 311 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 TDRG1Q3Y452 100 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 FBLN7Q53RD9 439 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 STPG4Q8N801 248 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 FXYD5Q96DB9 178 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 RCHY1Q96PM5 261 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 GAFA1Q96PS6 74 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 C5orf42Q9H799 3197 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.26□□□□□ -1.41
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