RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 CYGBQ8WWM9 190 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 MISP3Q96FF7 219 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 GFI1Q99684 422 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 BET1LQ9NYM9 111 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 RAB22AQ9UL26 194 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 PAGE4O60829 102 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 IGLV2-14P01704 120 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 TAS2R60P59551 318 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 PLA2G7Q13093 441 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 Q56UQ5 140 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 Q6ZS49 121 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 AHSA2Q719I0 299 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 STHQ8IWL8 128 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 BORCS5Q969J3 196 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 FABP12A6NFH5 140 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 C16orf90A8MZG2 172 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 F8W036 122 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 TEX46H3BTG2 121 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 MFNGO00587 321 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 CDK2AP2O75956 126 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 YIF1AO95070 293 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 IFNA21P01568 189 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 IFNA17P01571 189 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 OR13C7P0DN81 318 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 UCP3P55916 312 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 DEFB131AP59861 70 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 GPR107Q5VW38 600 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 LEMD1Q68G75 181 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 TCF24Q7RTU0 167 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 ERASQ7Z444 233 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM203Q969S6 136 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 MND1Q9BWT6 205 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 UPK2O00526 184 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 CCSO14618 274 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 ARL6IP5O75915 188 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 SERPINE2P07093 398 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 NPY1RP25929 384 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 C12orf74Q32Q52 190 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 GPHA2Q96T91 129 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 V9GY05 133 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
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