RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 LEPP41159 167 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 CXCR4P61073 352 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 GNMTQ14749 295 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 KISS1Q15726 138 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 MPV17LQ2QL34 196 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 KLK9Q2XQG4 91 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 CLEC19AQ6UXS0 136 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 ARPINQ7Z6K5 226 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 SLC25A42Q86VD7 318 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 STX19Q8N4C7 294 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 TTC9CQ8N5M4 171 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 UFD1Q92890 307 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 TTTY10Q9BZA0 68 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 OR51M1Q9H341 326 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 GID8Q9NWU2 228 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 KLK9Q9UKQ9 250 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 RNF24Q9Y225 148 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 HSBP1L1C9JCN9 74 aa3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 ITGB1BP1O14713 200 aa3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 MRASO14807 208 aa3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 CA11O75493 328 aa3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 ISG15P05161 165 aa3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 ALDH3B2P48448 385 aa3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 HAMPP81172 84 aa3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 OR5I1Q13606 314 aa3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 HSP90B2PQ58FF3 399 aa3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 RPL39P5Q59GN2 51 aa3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 LELP1Q5T871 98 aa3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 AQP11Q8NBQ7 271 aa3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 TEX47Q8TBZ9 253 aa3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 OR2A7Q96R45 310 aa3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 ATP5SQ99766 215 aa3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 APOL4Q9BPW4 351 aa3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 OCR1Q9BZK8 76 aa3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 TAF9BQ9HBM6 251 aa3.51□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 AMBNQ9NP70 447 aa3.51□□□□□ -1.85
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TRIM25-208ENST00000574234 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa3.51□□□□□ -1.85
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TRIM25-208ENST00000574234 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa3.5□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 A0A1B0GWB2 263 aa3.5□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 E9PLD3 99 aa3.5□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 K7EMT4 169 aa3.5□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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TRIM25-208ENST00000574234 C1QBP02746 253 aa3.5□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 REG1AP05451 166 aa3.5□□□□□ -1.85
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TRIM25-208ENST00000574234 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 RSU1Q15404 277 aa3.5□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 ZSCAN26Q16670 478 aa3.5□□□□□ -1.85
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TRIM25-208ENST00000574234 MS4A15Q8N5U1 240 aa3.5□□□□□ -1.85
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TRIM25-208ENST00000574234 OR4K15Q8NH41 348 aa3.5□□□□□ -1.85
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TRIM25-208ENST00000574234 NEK7Q8TDX7 302 aa3.5□□□□□ -1.85
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TRIM25-208ENST00000574234 GALMQ96C23 342 aa3.5□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 SPIN2AQ99865 258 aa3.5□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa3.5□□□□□ -1.85
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TRIM25-208ENST00000574234 UPK3BQ9BT76 320 aa3.5□□□□□ -1.85
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TRIM25-208ENST00000574234 SPACA1Q9HBV2 294 aa3.5□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 CLN6Q9NWW5 311 aa3.5□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 KCNIP1Q9NZI2 227 aa3.5□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 LRRC42Q9Y546 428 aa3.5□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 A0A087WTM6 91 aa3.49□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 TRAV2A0A0B4J234 112 aa3.49□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa3.49□□□□□ -1.85
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