RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 AADACL3Q5VUY0 350 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 CST9Q5W186 159 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 CLECL1Q8IZS7 167 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 SYCE1Q8N0S2 351 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 PLPP5Q8NEB5 264 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 OR2T4Q8NH00 348 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 OR10AC1Q8NH08 325 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 MCFD2Q8NI22 146 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 ITFG2Q969R8 447 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 ULBP3Q9BZM4 244 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 HDHD2Q9H0R4 259 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 MIXL1Q9H2W2 232 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 MAP1LC3AQ9H492 121 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 FAM96AQ9H5X1 160 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 MED29Q9NX70 200 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 TNFSF18Q9UNG2 199 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 CACNA1AO00555 2505 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 NCOR1O75376 2440 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 STAB1Q9NY15 2570 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 PTPN13Q12923 2485 aa-0.14□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 MYO7AQ13402 2215 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 TLCD2A6NGC4 264 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 EVPLLA8MZ36 301 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 LYZL6O75951 148 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 IGKV1-5P01602 117 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 TYMSP04818 313 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 MGST1P10620 155 aaKnown RBP-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 SSR2P43308 183 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 MARCKSL1P49006 195 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 RSU1Q15404 277 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 KHDC3LQ587J8 217 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 SLC51BQ86UW2 128 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 COMMD7Q86VX2 200 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 ATOH7Q8N100 152 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 CNBD2Q96M20 576 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 SCGB3A1Q96QR1 104 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 TP73-AS1Q9UF72 201 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 LOC285556D6RIA3 1793 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 CELSR2Q9HCU4 2923 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 TAF1LQ8IZX4 1826 aa-0.15□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 TOPBP1Q92547 1522 aa-0.16□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 CHD9Q3L8U1 2897 aa-0.16□□□□□ -2.43
FAM227B-211ENST00000560557 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 PQLC2LA1A4F0 135 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 NUPR2A6NF83 97 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 SMIM9A6NGZ8 99 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 C5orf67F2Z3F1 127 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 K7EIL1 84 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 OR2B3O76000 313 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF682O95780 498 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 TCL1BO95988 128 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 COX6A1P12074 109 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 RPL12P30050 165 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 UBE2G2P60604 165 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 IFITM2Q01629 132 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 RHEBQ15382 184 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 BATFQ16520 125 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 C12orf74Q32Q52 190 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 LINC01554Q52M75 96 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 SPRNQ5BIV9 151 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 Q5BKY6 102 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 CDKL4Q5MAI5 379 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 SPANXN3Q5MJ09 141 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 C1orf195Q5TG92 126 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 SFXN4Q6P4A7 337 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 ALKAL1Q6UXT8 129 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 IQCF2Q8IXL9 164 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 C3orf56Q8N813 242 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 PXT1Q8NFP0 134 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 OR5A1Q8NGJ0 315 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 TERB2Q8NHR7 220 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 DNAJC9Q8WXX5 260 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 PSMF1Q92530 271 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 DIRAS2Q96HU8 199 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 C14orf105Q9NVL8 296 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 C15orf41Q9Y2V0 281 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 RNF11Q9Y3C5 154 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 RIC1Q4ADV7 1423 aa-0.16□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-0.16□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.4 ms