RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560272.1

LINS1-208, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 2

Gene LINS1, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-208	ENST00000560272	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	ZNF124	Q15973	351 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	STH	Q8IWL8	128 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	AP3S1	Q92572	193 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	YIPF6	Q96EC8	236 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	METTL26	Q96S19	204 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	VSIR	Q9H7M9	311 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	RABAC1	Q9UI14	185 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.38	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	TNC	P24821	2201 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	FAM25A	B3EWG3	89 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	FAM25C	B3EWG5	89 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	FAM25G	B3EWG6	89 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	C11orf94	C9JXX5	98 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272		M0QYG6	137 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	HPGDS	O60760	199 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	DEDD	O75618	318 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	SPP1	P10451	314 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	TBP	P20226	339 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	NPPC	P23582	126 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	OPRK1	P41145	380 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	PIGP	P57054	158 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	DEFB131A	P59861	70 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	RND3	P61587	244 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	SPINK9	Q5DT21	86 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	TMEM230	Q96A57	120 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272		A0A0B4J293	547 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272		A0A1B0GU03	582 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	IGLL5	B9A064	214 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	DEFB4A	O15263	64 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	CLN5	O75503	358 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	B3GALNT1	O75752	331 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	TMEM50A	O95807	157 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	IGKV1-5	P01602	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	MIF	P14174	115 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	ELK1	P19419	428 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	PI3	P19957	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	ETV6	P41212	452 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	RORC	P51449	518 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	PPP5C	P53041	499 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	NCS1	P62166	190 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	OR4X1	Q8NH49	305 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	TP53RK	Q96S44	253 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	HELT	A6NFD8	242 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272		K7EQG2	157 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	CD3D	P04234	171 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	ZNF688	P0C7X2	276 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272		P0C879	139 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	UCP1	P25874	307 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	CRYBB3	P26998	211 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	HTR2B	P41595	481 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	P2RY1	P47900	373 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	TAS2R19	P59542	299 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	SPCS3	P61009	180 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	VBP1	P61758	197 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-208	ENST00000560272	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms