RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556082.5

ATXN3-235, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 660 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-235ENST00000556082 MT-CO2P00403 227 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 CNTFRP26992 372 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 OR10J1P30954 320 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 LGALS4P56470 323 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 LCN2P80188 198 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 SSX2Q16385 188 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 TNXAQ16473 311 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 AWAT1Q58HT5 328 aa6.6□□□□□ -1.35
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ATXN3-235ENST00000556082 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.6□□□□□ -1.35
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ATXN3-235ENST00000556082 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 AJUBAQ96IF1 538 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 TBX15Q96SF7 602 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 CCL19Q99731 98 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.6□□□□□ -1.35
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ATXN3-235ENST00000556082 FBXL15Q9H469 300 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 TNCP24821 2201 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 COLCA2A8K830 154 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 F6UZH7 168 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 M0R036 132 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 FCN1O00602 326 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 TSPAN4O14817 238 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 PDE6DO43924 150 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 OR5G3P0C626 314 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 RNF224P0DH78 156 aa6.59□□□□□ -1.35
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ATXN3-235ENST00000556082 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.59□□□□□ -1.35
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ATXN3-235ENST00000556082 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 SYT8Q8NBV8 401 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 TRGV9Q99603 122 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 FUT9Q9Y231 359 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-235ENST00000556082 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
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ATXN3-235ENST00000556082 PAGE4O60829 102 aa6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-235ENST00000556082 FAM106CPP0CH98 169 aa6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-235ENST00000556082 AREGP15514 252 aa6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-235ENST00000556082 GCHFRP30047 84 aa6.58□□□□□ -1.36
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ATXN3-235ENST00000556082 MMDQ15546 238 aa6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-235ENST00000556082 KLK9Q2XQG4 91 aa6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-235ENST00000556082 RNF212Q495C1 297 aa6.58□□□□□ -1.36
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ATXN3-235ENST00000556082 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-235ENST00000556082 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.58□□□□□ -1.36
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ATXN3-235ENST00000556082 C1RLQ9NZP8 487 aa6.58□□□□□ -1.36
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ATXN3-235ENST00000556082 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.58□□□□□ -1.36
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ATXN3-235ENST00000556082 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.57□□□□□ -1.36
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ATXN3-235ENST00000556082 C11orf94C9JXX5 98 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-235ENST00000556082 I3L2K1 104 aa6.57□□□□□ -1.36
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ATXN3-235ENST00000556082 CNIH1O95406 144 aa6.57□□□□□ -1.36
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ATXN3-235ENST00000556082 PRB1P04280 392 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-235ENST00000556082 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-235ENST00000556082 C8orf88P0DMB2 117 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-235ENST00000556082 FOLR2P14207 255 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-235ENST00000556082 CTRB1P17538 263 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-235ENST00000556082 ATP5J2P56134 94 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-235ENST00000556082 TAS2R45P59539 299 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-235ENST00000556082 PLP1P60201 277 aa6.57□□□□□ -1.36
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