RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	CCS	O14618	274 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	CYB5B	O43169	146 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	NDUFB8	O95169	186 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	IGHV3-11	P01762	117 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	SNCA	P37840	140 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	TATDN3	Q17R31	274 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	C15orf32	Q32M92	178 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	NEURL2	Q9BR09	285 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	RBKS	Q9H477	322 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	THYN1	Q9P016	225 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	OR8U8	P0C7N1	319 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	ID3	Q02535	119 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	ATP5G2	Q06055	141 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	DTD1	Q8TEA8	209 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222		A0A087WW49	117 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	MED6	O75586	246 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	HTR2B	P41595	481 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	ACSM6	Q6P461	480 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222		U3KQ87	197 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-231	ENST00000552222	C5orf51	A6NDU8	294 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	FAM25E	A8MYX2	175 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222		K7EIM0	57 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	SYNGR2	O43760	224 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	10.45	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	C2orf83	Q53S99	150 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	CXorf58	Q96LI9	332 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	ALG5	Q9Y673	324 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222		I3L2K1	104 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	SSNA1	O43805	119 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	TRBV12-3	P01733	135 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	IAPP	P10997	89 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	IL15RA	Q13261	267 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	PMS2P11	Q13670	270 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	FAM209B	Q5JX69	171 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	MISP3	Q96FF7	219 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	C2orf50	Q96LR7	162 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	CCDC140	Q96MF4	163 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222		S4R3C0	116 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222		A8MZ25	164 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	CORT	O00230	105 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	WRB	O00258	174 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	GOSR2	O14653	212 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	MT-CO2	P00403	227 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	IFNA10	P01566	189 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	NPY1R	P25929	384 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	NOXA1	Q86UR1	476 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	ATP6V0B	Q99437	205 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	LINC01619	G3V211	115 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	BMPR1B	O00238	502 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	SSSCA1	O60232	199 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	SIX6	O95475	246 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	SCGB1D2	O95969	90 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	IGHV3-23	P01764	117 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	H2BFS	P57053	126 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	10.42	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	AKAP14	Q86UN6	197 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	C15orf62	A8K5M9	175 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222		F8W735	103 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74

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