RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 IFNA5P01569 189 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 APELAP0DMC3 54 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 S100A7P31151 101 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 TPPP2P59282 170 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 VWC2Q2TAL6 325 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 C15orf32Q32M92 178 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 Q5BKY6 102 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 OR8G2PQ6IF36 304 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 OR4X1Q8NH49 305 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 TMEM158Q8WZ71 300 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 ATP5SQ99766 215 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 TMEM147Q9BVK8 224 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-220ENST00000550700 NF1P21359 2839 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 PRSS46E5RG02 174 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 I3L2K1 104 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 OR2J3O76001 311 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 PROK1P58294 105 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 NHLH2Q02577 135 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 TEPPQ6URK8 271 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 TMEM144Q7Z5S9 345 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 TMEM217Q8N7C4 229 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 OR11H4Q8NGC9 324 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 MYOZ3Q8TDC0 251 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 SCARB1Q8WTV0 552 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 RNF222A6NCQ9 220 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 SMLR1H3BR10 107 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 K7EIM0 57 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 BCL2L11O43521 198 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 GNG7O60262 68 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 CLN5O75503 358 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 NDUFB8O95169 186 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 MFAP2P55001 183 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 SELENOTP62341 195 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 AKR1C1Q04828 323 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 ACSM6Q6P461 480 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 TMUB2Q71RG4 321 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 S100A7AQ86SG5 101 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 ZNF329Q86UD4 541 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 ZNF709Q8N972 641 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 UBAC2Q8NBM4 344 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 MS4A10Q96PG2 267 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 ARL6Q9H0F7 186 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 SMCO3A2RU48 225 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 RUNX1Q01196 453 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 GAMTQ14353 236 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 Q56UQ5 140 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 ZNF343Q6P1L6 599 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 THAP8Q8NA92 274 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 TRGV9Q99603 122 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 FBXL17Q9UF56 701 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 RNF24Q9Y225 148 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 ZFP92A6NM28 416 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 PRH1P02810 166 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 CXCL2P19875 107 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 MDKP21741 143 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 ZP3P21754 424 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 RND2P52198 227 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 CD300CQ08708 224 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 CLINT1Q14677 625 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-220ENST00000550700 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms