RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
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PTPRB-208ENST00000550358 ERVK11-1P61568 191 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-208ENST00000550358 SEC11AP67812 179 aa7.04□□□□□ -1.28
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PTPRB-208ENST00000550358 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
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PTPRB-208ENST00000550358 H3BVH4 76 aa7.04□□□□□ -1.28
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PTPRB-208ENST00000550358 CRPP02741 224 aa7□□□□□ -1.29
PTPRB-208ENST00000550358 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRB-208ENST00000550358 FAM201AQ5SY85 155 aa7□□□□□ -1.29
PTPRB-208ENST00000550358 RFNGQ9Y644 331 aa7□□□□□ -1.29
PTPRB-208ENST00000550358 SPAG17Q6Q759 2223 aa7□□□□□ -1.29
PTPRB-208ENST00000550358 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7□□□□□ -1.29
PTPRB-208ENST00000550358 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
PTPRB-208ENST00000550358 LMO1P25800 156 aa7□□□□□ -1.29
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