RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547715.1

PTPRB-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-205ENST00000547715 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 MYOD1P15172 320 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 AREGP15514 252 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 GPR183P32249 361 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 MFAP2P55001 183 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 ELLP55199 621 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 ACSM3Q53FZ2 586 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 APRG1Q8IVJ8 170 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 OR11H2Q8NH07 326 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 ABHD1Q96SE0 405 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 CABLES2Q9BTV7 478 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 CSTL1Q9H114 145 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 SLC2A9Q9NRM0 540 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 ETV7Q9Y603 341 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRB-205ENST00000547715 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 METTL21EPA6NDL7 271 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 OR4C46A6NHA9 309 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 PRSS29PA6NIE9 313 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 SLC25A4P12235 298 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 DEFA4P12838 97 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 PSMB6P28072 239 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 OR2B11Q5JQS5 317 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 PLAC9Q5JTB6 97 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 CD300LFQ8TDQ1 290 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 CXorf58Q96LI9 332 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 SEC11CQ9BY50 192 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 HRASLSQ9HDD0 168 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 A0A1B0GW64 132 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 C1orf196B1AJZ1 125 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 KBTBD11O94819 623 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 RLN2P04090 185 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 REG1AP05451 166 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 CRYGCP07315 174 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF735P0CB33 412 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF124Q15973 351 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 KCTD9Q7L273 389 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 C15orf54Q8N8G6 183 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 MAFIPQ8WZ33 124 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 DNAH11Q96DT5 4516 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 C11orf94C9JXX5 98 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 FCGR3AP08637 254 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 SMCO1Q147U7 214 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 KCNRGQ8N5I3 272 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 OR56B1Q8NGI3 324 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 OR4A5Q8NH83 315 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 VSTM2AQ8TAG5 236 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM190Q8WZ59 177 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 ST8SIA2Q92186 375 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 DIRAS3O95661 229 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 CD37P11049 281 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 MAS1LP35410 378 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 ARFRP1Q13795 201 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 ALKAL2Q6UX46 152 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 THAP6Q8TBB0 222 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF502Q8TBZ5 544 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 SMCO4Q9NRQ5 59 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 RAB27BO00194 218 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 BCL2L11O43521 198 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 IFNA10P01566 189 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 RPL30P62888 115 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 KLK9Q2XQG4 91 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 BPIFCQ8NFQ6 507 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 COMMD9Q9P000 198 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 KLK9Q9UKQ9 250 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 RNF222A6NCQ9 220 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 SLC17A2O00624 439 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 RTL8CO15255 209 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 ARPC5O15511 151 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 TGOLN2O43493 480 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 UCHL1P09936 223 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 ADMP35318 185 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 CCR6P51684 374 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 CLDN12P56749 244 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 PEA15Q15121 130 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 SSX9Q7RTT3 188 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF645Q8N7E2 425 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 STOML3Q8TAV4 291 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 RAB3CQ96E17 227 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRB-205ENST00000547715 C20orf24Q9BUV8 137 aa10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms