RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 CACNA1DQ01668 2161 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 DYSFO75923 2080 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 DSCAMO60469 2012 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 A0A0G2JRQ6 117 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 TMEM250H0YL14 139 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 J3QR89 54 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 M0R1X1 148 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 PDE6DO43924 150 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 KBTBD11O94819 623 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 IGKV1-39P01597 117 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 IGKV1D-39P04432 117 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 CGB3P0DN86 165 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 CGB7P0DN87 165 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 RHOBP62745 196 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 HERV-K104P63124 156 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 HSD52Q0P140 79 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 CATR1Q13166 79 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 CDSNQ15517 529 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 LTC4SQ16873 150 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 COX19Q49B96 90 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 Q6ZVH6 145 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 CALYQ9NYX4 217 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 GNG12Q9UBI6 72 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 RFNGQ9Y644 331 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 A0A1W2PPV4 95 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 GAGE10A6NGK3 116 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 TMEM178BH3BS89 294 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 SSSCA1O60232 199 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 PLAUP00749 431 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 IFNA5P01569 189 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 IGKV1-5P01602 117 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 MMP9P14780 707 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 IL3RAP26951 378 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 ATP6V0CP27449 155 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 LOXL3P58215 753 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 PLP1P60201 277 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 ID3Q02535 119 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 FOXL1Q12952 345 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 SPTA1P02549 2419 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 IGSF23A1L1A6 192 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 OR2T8A6NH00 312 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 K7EP34 96 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 SLC17A3O00476 420 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 TMPRSS2O15393 492 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 NUPR1O60356 82 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 BRI3O95415 125 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 CLDN1O95832 211 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 IGHG4P01861 327 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 LINC00869P0C866 280 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 OMGP23515 440 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 GPR12P47775 334 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 LINC00310P59036 64 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 SEC11AP67812 179 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 TFF3Q07654 80 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 ADIRFQ15847 76 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 Q6ZRM9 215 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 TCF23Q7RTU1 214 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 OR2C3Q8N628 320 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 CCL17Q92583 94 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 ST20Q9HBF5 79 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 CACNG5Q9UF02 275 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 ARID1AO14497 2285 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-204ENST00000546621 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms